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xuzhj01金蟲 (小有名氣)
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[交流]
請幫忙看看我計算HOMO LUMO是否正確，謝謝！ 已有3人參與
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要求： 一、The ground-state geometries of the protonated dyes have been optimized in the gas phase by DFT with the Gaussian09 package, using the hybrid B3LYP functional and the standard 6-31G(d) basis set. 二、Thecalculations were performed with MPW1K functional and 6-31+G(d) basis set on the B3LYP optimized ground-state geometries. Solvation effect were included in the TDDFT calculations in CH2Cl2 with the nonequilibrium version of the C-PCM model. 計劃流程： 1： 在chemdraw中畫出需要計算的分子 2： 導(dǎo)入CHEM3D 進(jìn)行基本的MMP2能量優(yōu)化，得到最優(yōu)構(gòu)象，轉(zhuǎn)成Z坐標(biāo) 3、按照第一步優(yōu)化， 4、準(zhǔn)備Gaussian輸入文件（對應(yīng)以上第二步計算） 第一步輸入文件如下： %mem=1GB %chk=D:\DSSC\calHOMO.chk # opt b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity calHOMO 0 1 第二步輸入文件如下： %mem=1GB %chk=D:\DSSC\calHOMO.chk # opt freq mpw1pw91/6-31g(d) scrf=(cpcm,solvent=dichloromethane) geom=connectivity calHOMO 0 1 ×××××××分子坐標(biāo) 請大家?guī)兔纯矗@樣的過程是否正確，謝謝 [ Last edited by xuzhj01 on 2011-5-19 at 10:41 ] |
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zhangmt
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gmy1990(金幣+1): 非常感謝你對論壇的貢獻(xiàn)，獎勵一下！ 2011-05-19 12:51:29
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 樓主莫動氣，二樓也是一片好意，只是告訴里，紙上得來終覺淺。為什么不先試著運(yùn)行一下，出了問題再提出來問呢？自己運(yùn)行過的和別人告訴你的，可能結(jié)果是一樣的，收獲卻有多有少。 其次，在壇子里提問要有針對性，要把問題描述得清楚。 如方說，你可以說：“這個計算是用xx方法算yy性質(zhì)，以下是我的計算流程，其中的XX部分我不是很有把握，請大家?guī)臀铱纯�。�?太籠統(tǒng)的問題，人看到了就算是有心幫你，也不知道怎么答了。  |
4樓2011-05-19 11:02:24
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呵呵 謝謝提醒，我以前是做生物大分子的，基本上沒有接觸量子化學(xué)方面； 現(xiàn)在想學(xué)習(xí)一下，可能是我接觸少表達(dá)不清。 不知道這樣是否正確： 要求是計算一個新分子的HOMO以及LUMO軌道，計算他的躍遷能量，以此判斷分子的電子遷移能力。 文獻(xiàn)的上的描述 應(yīng)該是先優(yōu)化結(jié)構(gòu) 然后再計算它的HOMO以及LUMO能量 我也是按照手冊來做的這個計算，就是不知道一些參數(shù)設(shè)置是否正確。 我學(xué)新的東西希望先動手，然后再看書，我覺得這樣好理解理論，可能每個人不一樣。 |
5樓2011-05-19 11:15:57
zhangmt
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7樓2011-05-19 11:41:57
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簡單地說一下我的看法吧： 畫分子用GView就可以了。 計算過程： %chk=calHOMO.chk %mem=6GB %nprocs=4 #p opt b3lyp/6-31g(d) title 1 2 所有原子初始坐標(biāo) --link1-- %chk=calHOMO.chk #p freq(noraman) b3lyp/6-31g(d) geom=check guess=read title 1 2 --link1-- %chk=calHOMO.chk #p mpw1pw91/6-31+g(d) td(nstate=20) geom=check guess=read scrf=(cpcm,solvent=dichloromethane) title 1 2 --link1-- %chk=calHOMO.chk #p mpw1pw91/6-31+G(d) SCRF=(cpcm,solvent=dichloromethane,Read) Geom=Check Guess=Read title 1 2 NonEq=write --link1-- %chk=calHOMO.chk #p mpw1pw91/6-31+G(d) TD(NStates=20,Root=1) SCRF=(cpcm,solvent=dichloromethane,ExternalIteration, Read) Geom=Check Guess=Read title 1 2 NonEq=read 以上僅為個人猜測，應(yīng)該不會太離譜�？偟挠嬎�，如果有個好點(diǎn)的機(jī)器，一個星期能拿出結(jié)果，雖然說是這么說，但做起來，如果沒有人指導(dǎo)，3個月能做出來，你就是神童了。我本以為是你導(dǎo)師給的題目，所以感覺好像導(dǎo)師不太負(fù)責(zé)任的意思。不給指導(dǎo)，自學(xué)幾乎是做不了的。 [ Last edited by zhangmt on 2011-5-19 at 15:15 ] |
8樓2011-05-19 15:13:35
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