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五瓣丁香BBG金蟲(chóng) (小有名氣)
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求教如何通過(guò)GenBankTM/EBI Data Bank 查到核酸序列
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rt，我是外行，看到這個(gè) The nucleotide sequence(s) reported in this paper has been submitted to the GenBankTM/EBI Data Bank with accession number(s) AB017626, AB017627, AB017628, and AB017629 (for ScGNA1, CaGNA1, SpGNA1, and CeGNA1, respectively) 我很想通過(guò)上述信息查到scgna1的基因序列��！ 先謝謝了 |
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1949stone(金幣+2): 了解 2011-05-24 15:43:06
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（1） 這些信息中已經(jīng)有了序列的申請(qǐng)?zhí)枺篈B017626, AB017627, AB017628, and AB017629 ，你可以直接在GenBank中輸入，然后下載出來(lái) （2）另外，文章中還給了名字： ScGNA1, CaGNA1, SpGNA1, and CeGNA1，你可以分別輸入名字，在GenBank中找到相關(guān)序列。 要注意的是，你的序列是什么？是DNA、蛋白質(zhì)、cDNA？還是其他，這個(gè)可以選擇，當(dāng)然也可以不選擇，你具體操作一下就知道了。有問(wèn)題在發(fā)信息給我。 祝福實(shí)驗(yàn)順利！ |
2樓2011-05-24 14:25:50
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3樓2011-05-24 14:27:33
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1949stone(金幣+1): 不錯(cuò) 2011-05-24 15:43:31
1949stone(金幣+1): 不錯(cuò) 2011-05-24 15:43:31
| http://www.ncbi.nlm.nih.gov/這是GenBank的網(wǎng)址 |
4樓2011-05-24 14:53:21
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1949stone(EPI+1): 鑒于你的熱情 與 解答 epi來(lái)也 2011-05-24 15:43:55
| 這個(gè)網(wǎng)站上有好多生物信息學(xué)的東西，可以學(xué)習(xí)http://abc.cbi.pku.edu.cn/ |
5樓2011-05-24 14:55:10
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AB017626 Saccharomyces cerevisiae ScGNA1 gene for acetyltransferase, complete cds GenBank: AB017626.1 FASTA Graphics Go to: LOCUS AB017626 480 bp DNA linear PLN 08-JAN-1999 DEFINITION Saccharomyces cerevisiae ScGNA1 gene for acetyltransferase, complete cds. ACCESSION AB017626 VERSION AB017626.1 GI:4115732 KEYWORDS acetyltransferase; ScGNA1. SOURCE Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast) ORGANISM Saccharomyces cerevisiae Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes; Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Saccharomyces. REFERENCE 1 AUTHORS Mio,T., Yamada-Okabe,T., Arisawa,M. and Yamada-Okabe,H. TITLE Saccharomyces cerevisiae GNA1, an essential gene encoding a novel acetyltransferase involved in UDP-N-acetylglucosamine synthesis JOURNAL J. Biol. Chem. 274 (1), 424-429 (1999) PUBMED 9867860 REFERENCE 2 (bases 1 to 480) AUTHORS Okabe,H. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (12-SEP-1998) Hisafumi Okabe, Yokohama City University, School of Medicine, Department of Hygiene; 3-9 Fukuura, Kanazawa-ku, Yokohama, Kanagawa 236-0004, Japan (E-mail:toshiko@med.yokohama-cu.ac.jp, Tel:81-45-787-2606, Fax:81-45-786-5219) FEATURES Location/Qualifiers source 1..480 /organism="Saccharomyces cerevisiae" /mol_type="genomic DNA" /db_xref="taxon:4932" gene 1..480 /gene="ScGNA1" CDS 1..480 /gene="ScGNA1" /codon_start=1 /product="acetyltransferase" /protein_id="BAA36495.1" /db_xref="GI:4115733" /translation="MSLPDGFYIRRMEEGDLEQVTETLKVLTTVGTITPESFSKLIKY WNEATVWNDNEDKKIMQYNPMVIVDKRTETVAATGNIIIERKIIHELGLCGHIEDIAV NSKYQGQGLGKLLIDQLVTIGFDYGCYKIILDCDEKNVKFYEKCGFSNAGVEMQIRK" ORIGIN 1 atgagcttac ccgatggatt ttatataagg cgaatggaag agggggattt ggaacaggtc 61 actgagacgc taaaggtttt gaccaccgtg ggcactatta cccccgaatc cttcagcaaa 121 ctcataaaat actggaatga agccacagta tggaatgata acgaagataa aaaaataatg 181 caatataacc ccatggtgat tgtggacaag cgcaccgaga cggttgccgc tacggggaat 241 atcatcatcg aaagaaagat cattcatgaa ctggggctat gtggccacat cgaggacatt 301 gcagtaaact ccaagtatca gggccaaggt ttgggcaagc tcttgattga tcaattggta 361 actatcggct ttgactacgg ttgttataag attattttag attgcgatga gaaaaatgtc 421 aaattctatg aaaaatgtgg gtttagcaac gcaggcgtgg aaatgcaaat tagaaaatag // |
6樓2011-05-24 20:17:48
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