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xcyqyz5233金蟲 (小有名氣)
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[求助]
有兩個(gè)問(wèn)題很困惑！
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1.保存基態(tài)優(yōu)化后的坐標(biāo)可以在out文件中找到，有兩種方法： （1）用gview打開out文件，然后保存gjf文件，就可以得到分子坐標(biāo)啦 （2）out文件中在優(yōu)化完成最后有 Standard orientation:部分即是，不過(guò)你得把其中的部分?jǐn)?shù)據(jù)刪掉。這個(gè)可以在word中完成。 但是本人發(fā)現(xiàn)兩種方式所得到的坐標(biāo)是不一樣的，兩種方法都對(duì)嗎？還是有什么區(qū)別？ 2.優(yōu)化激發(fā)態(tài)的方法有兩種： （1）優(yōu)化激發(fā)態(tài)：以H2O為例 先用hf/6-31g 方法計(jì)算（h2O-hf.gjf），得到的構(gòu)型再用cis(nstates=1,direct,singlet)/6-31g計(jì)算(h20-cisopt.gjf)，其結(jié)果用于下一步的光譜計(jì)算。 （2）直接可以用基態(tài)優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)作為激發(fā)態(tài)的分子說(shuō)明，然后用 hf/6-31g cis(singlets,nstates=5) 來(lái)計(jì)算，其結(jié)果用于下一步的光譜計(jì)算。 這兩種方法都對(duì)嗎？？有什么區(qū)別嗎？ 謝謝各位咯！呵呵 |
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yongma2008
木蟲 (著名寫手)
論文？苦！主。
- 應(yīng)助: 34 (小學(xué)生)
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- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
xcyqyz5233(金幣+10): 謝謝您的指點(diǎn)和回復(fù)！哈哈，明白了 2011-05-27 19:35:05
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第一個(gè)問(wèn)題，原子坐標(biāo)會(huì)因?yàn)樽鴺?biāo)原點(diǎn)的位置和坐標(biāo)軸的取向不同而不同，所以不用糾結(jié)于得到的兩種坐標(biāo)的xyz值是不是完全一樣，關(guān)鍵問(wèn)題是原子的相對(duì)位置，如果兩種坐標(biāo)下的原子相對(duì)位置一樣，那就是一樣的。 第二個(gè)沒(méi)算過(guò)，樓下的來(lái)說(shuō)一下。 |
2樓2011-05-27 17:49:22
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