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tuobaohua榮譽(yù)版主 (文壇精英)
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NCBI中新序列的登錄號(hào)怎么獲取？
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新測(cè)序得到一段16S rRNA序列，看到外文文獻(xiàn)中都有自己所測(cè)序列在NCBI中的登錄號(hào)。自己也嘗試著按照百度里面別人提供的方法試了一下，由于描述太簡(jiǎn)單，還是沒(méi)有成功，不知道該怎樣操作。 本人為分子新手，勞煩各位高手幫幫忙，教教我怎樣去獲得這個(gè)accession number。 不勝感激�。�！  |
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西瓜
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tuobaohua5樓2011-06-05 18:21:40
andy99990000
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【答案】應(yīng)助回帖
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dhd997(金幣+3): good 2011-05-31 11:09:22
tuobaohua(金幣+4): 是哪個(gè)軟件？能否給個(gè)鏈接，NCBI的主頁(yè)上那么多東西，我還真不知道點(diǎn)哪個(gè)開(kāi)始。期待回復(fù)，非常謝謝哈！ 2011-05-31 16:55:16
dhd997(金幣+3): good 2011-05-31 11:09:22
tuobaohua(金幣+4): 是哪個(gè)軟件？能否給個(gè)鏈接，NCBI的主頁(yè)上那么多東西，我還真不知道點(diǎn)哪個(gè)開(kāi)始。期待回復(fù)，非常謝謝哈！ 2011-05-31 16:55:16
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其實(shí)就是用NCBI自帶的那個(gè)軟件，一步步按照它的指引填入你的信息，我記得有文章名，作者，學(xué)校，等等吧。然后就是粘貼上你的序列，可以一次多序列上傳，最后生成一個(gè)提交文件，然后將這個(gè)文件用你文章通訊作者的郵箱發(fā)到NCBI的新序列接收那個(gè)地址。大概1-2周后，他們就會(huì)把所有你提交的序列accession number發(fā)給你了，一般是順號(hào)的。 有一點(diǎn)要額外注意，在生成那個(gè)提交文件的時(shí)候，會(huì)有一個(gè)復(fù)選框問(wèn)你何時(shí)準(zhǔn)備公布你的序列信息，這個(gè)按你老板的意思去填，一般會(huì)保留信息1年左右再公布，這樣實(shí)驗(yàn)室后續(xù)實(shí)驗(yàn)便不會(huì)受太多外界的影響。 個(gè)人經(jīng)驗(yàn)，希望有所幫助~~ |
2樓2011-05-31 10:44:30
西瓜
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1949stone(金幣+5): good 2011-06-05 16:15:14
1949stone(金幣+5): good 2011-06-05 16:15:14
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NCBI上提交序列有好幾種方法，這個(gè)頁(yè)面有說(shuō)明： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/submit.html 不想下軟件的話，也可以直接用BankIt從網(wǎng)頁(yè)提交： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/?tool=genbank BankIt: Submitting Via the WWW NCBI has developed a WWW form, called BankIt, for convenient and quick submission of sequence data. BankIt allows you to enter sequence information into a form, edit as necessary, and add biological annotation (e.g., coding regions, mRNA features). BankIt transforms your data into GenBank format for your review and when your record is completed, it can be submitted directly to GenBank. You have the option of adding information by using text boxes to describe in your own words the source of the sequence and its biological features. The GenBank annotation staff reviews the submitted textual information, incorporates it into the appropriate structured fields, and returns the record by e-mail for your review. BankIt is compatible with Netscape clients for Unix, Macs, and PCs. In addition, Internet Explorer for the PC and Mac have successfully been used. 使用前需要注冊(cè)（點(diǎn)擊右上角的“Sign in to use BankIt”）。 然后NCBI還提供了個(gè)The GenBank Submissions Handbook，里面有更多關(guān)于如何提交序列的說(shuō)明，可以看看： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK51157/ |
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tuobaohua
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4樓2011-06-05 15:50:09
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