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YJY1234金蟲 (初入文壇)
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fragment molecilar orbital method 方法
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| 用gamess中的FMO2/TDDFT(LCBLYP)模塊計(jì)算葉綠素分子的激發(fā)態(tài)能量時(shí)，用6-31g基組時(shí)，算到雙體都不能收斂，但用sto-3g則可以正常結(jié)束，這是什么原因，怎樣才能解決呢？ |
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2樓2011-06-11 16:33:45
YJY1234
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3樓2011-06-13 08:20:59
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意思就是，當(dāng)最低單重激發(fā)態(tài)并不發(fā)生在所選取的central fragment上時(shí)，而是從一個(gè)fragment躍遷到另一個(gè)fragment上，那么它所算的激發(fā)能就完全錯(cuò)誤。不信可以試下LDA，GGA之類的純泛函，和整體計(jì)算的結(jié)果相差十萬八千里。LC泛函修正可以確保最低單重激發(fā)態(tài)S1發(fā)生在central fragment上，不過這也是特殊情況，不具有普適性，S2及其他激發(fā)態(tài)可能就是上面提到的inter-fragment excitation，所以他們不報(bào)導(dǎo)。 你說的不收斂是指的FMO DFT 基態(tài)還是激發(fā)態(tài)計(jì)算。如果是激發(fā)態(tài)，就是每個(gè)子體系的常規(guī)TDDFT計(jì)算不收斂，這種情況很少見但還是可能發(fā)生的，但是文獻(xiàn)既然報(bào)導(dǎo)了結(jié)果，可能還是你在計(jì)算細(xì)節(jié)上出了問題。 |
4樓2011-06-13 22:47:40
YJY1234
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計(jì)算過程出了問題？同樣的結(jié)構(gòu)，關(guān)鍵詞也是一樣的，只是變化了基組。 用sto-3g得出的結(jié)果是：state excitation/ev transition dipole(a.u.) osc. 1 2.051 -2.7144 -0.9013 0.2738 0.415 用6-31g得出的結(jié)果是：state excitation/ev transition dipole(a.u.) osc. 1 **** 0.0000 0.0000 0.000 0.000 用LC-BLYP/6-31g計(jì)算時(shí)，激發(fā)態(tài)單體的能量就出現(xiàn)錯(cuò)誤了。 |
5樓2011-06-15 16:57:22
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計(jì)算過程出了問題？同樣的結(jié)構(gòu)，關(guān)鍵詞也是一樣的，只是變化了基組。 用sto-3g得出的結(jié)果是：state excitation/ev transition dipole(a.u.) osc. 1 2.051 -2.7144 -0.9013 0.2738 0.415 用6-31g得出的結(jié)果是：state excitation/ev transition dipole(a.u.) osc. 1 **** 0.0000 0.0000 0.000 0.000 用LC-BLYP/6-31g計(jì)算時(shí)，激發(fā)態(tài)單體的能量就出現(xiàn)錯(cuò)誤了。 |
6樓2011-06-15 17:13:25
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這個(gè)愛莫能助，沒有重復(fù)過那篇文獻(xiàn)的計(jì)算。文獻(xiàn)實(shí)際計(jì)算細(xì)節(jié)一般很多很多，漏了任何一個(gè)細(xì)節(jié)，可能都無法重復(fù)結(jié)果�？梢灾苯訉懶畔蚰莻�(gè)組詢問。 不過從你列的結(jié)果可以看到，6-31g的S1激發(fā)能可能是虛數(shù)。HOMO-LUMO gap太小了，后面的LC kernel修正太大（修正值是負(fù)數(shù)），激發(fā)能的平方就是負(fù)數(shù)，從而激發(fā)能是虛數(shù)。這么小的基組就出了這種問題，確實(shí)很難解釋，還是需要檢查一下輸入文件。 STO-3g不出問題是因?yàn)榛M太小了（沒有意義的基組），HOMO-LUMO gap比較大。 |
7樓2011-06-16 14:43:44
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