 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1348 | 回復(fù): 3 | |||
baiyuefei版主 (文學(xué)泰斗)
風(fēng)雪
|
[求助]
請(qǐng)高手用Platon算下我的這個(gè)單晶的C-H pi 作用是否存在？
|
|
我的晶體所有數(shù)據(jù)在下面 https://good.gd/1284907.htm 如題，請(qǐng)高手用Platon算下我的晶體是否存在C-H pi ，即C(28)-H(28A)***pi (benzene ring)是否存在呢，并把結(jié)果粘貼在過來看下。 至于怎么算以下是我搜索到的一個(gè)例子可供參考： platon自動(dòng)計(jì)算一下，即在platon中點(diǎn)擊“cacu all"會(huì)出現(xiàn)一個(gè)lis文件，在其中就可以找到你要的東西。如果程序認(rèn)為沒有這種作用，那么你可能在lis文件中就找不到下面的東西： ==================================================================================================================================== Analysis of Y-X...Cg(Pi-Ring) Interactions (X..Cg < 4.0 Ang. - Gamma < 30.0 Deg) ==================================================================================================================================== Y--X(I) Res(I) Cg(J) [ ARU(J)] X..Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S X-Perp Gamma Y-X..Cg Y..Cg Y-X,Pi C(19) -Cl(1) [ 1] -> Cg(5) [ 2564.02] 3.626(5) 0.9324 0.3227-0.1629 10.9734 3.614 4.66 93.9(3) 4.118(10) 0.72 C(39) -Cl(2) [ 2] -> Cg(1) [ 4555.01] 3.623(5) 0.3308-0.9275 0.1743 4.7128 3.612 4.63 93.7(4) 4.126(10) 0.91 ------- ---------------------------------------------- Min or Max 3.623 3.612 4.63 93.90 4.118 0.91 [ 2564] = X,1-Y,-1/2+Z [ 4555] = 1/2+X,1/2-Y,1/2+Z The Cg(I) refer to the Ring Centre-of-Gravity numbers given in () in the Ring-Analysis above |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
中南大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院易小藝教授課題組招收2026級(jí)博士研究生（第二輪）
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求助
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
無機(jī)化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有184人回復(fù)
-
0703化學(xué)26考研調(diào)劑，一志愿南昌大學(xué)
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
有沒有化學(xué)、材料專業(yè)的同學(xué)需要調(diào)劑 考慮天津高效的可以郵件或者私信
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
26年博士招生
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
江西理工大學(xué)功能晶態(tài)材料方向劉遂軍課題組招收2026年秋季入學(xué)博士研究生
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
寧夏大學(xué)團(tuán)簇新材料團(tuán)隊(duì)招收材料/化學(xué)/化工專業(yè)博士生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
MIL-101有單晶樣品嗎
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
西北大學(xué)26年化學(xué)博士招生
已經(jīng)有2人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- Cu在鋁合金中的作用
已經(jīng)有19人回復(fù)
- PI染色的問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 如何用Gaussian算或者顯示p-pi共軛作用
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】請(qǐng)問一下platon產(chǎn)生的氫鍵列表最后一列的對(duì)稱碼是干什么用的呢
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】請(qǐng)高手看看我的粉末衍射數(shù)據(jù)和單晶數(shù)據(jù)算不算對(duì)應(yīng)上？
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【交流】Platon 有多少功能
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】Platon算出Pi-Pi堆積作用寫入cif的格式
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】用platon中的squeeze程序是否可以處理高度無序的溶劑分子？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【請(qǐng)教】愛思維爾投稿問，用platon查得氫鍵，只將其中的對(duì)稱操作碼用xp修改過的，能否
已經(jīng)有9人回復(fù)
ys851216
木蟲 (正式寫手)
- CMEI: 2
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1934.2
- 帖子: 573
- 在線: 174.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 849448
- 注冊(cè): 2009-09-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 配位化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★
drg1984(金幣+1): 謝謝回帖交流！ 2011-06-15 15:51:09
baiyuefei(金幣+49): 2011-06-15 15:56:51
baiyuefei(金幣+51): 非常感謝 2011-06-15 19:01:00
drg1984(金幣+1): 謝謝回帖交流！ 2011-06-15 15:51:09
baiyuefei(金幣+49): 2011-06-15 15:56:51
baiyuefei(金幣+51): 非常感謝 2011-06-15 19:01:00
|
Analysis of X-H...Cg(Pi-Ring) Interactions (H..Cg < 3.0 Ang. - Gamma < 30.0 Deg) ==================================================================================================================================== X--H(I) Res(I) Cg(J) [ ARU(J)] H..Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S H-Perp Gamma X-H..Cg X..Cg X-H,Pi C(14) -H(14) [ 1] -> Cg(3) [ 6545.01] 2.93 -0.9967-0.0403-0.0710 -9.3463 2.76 19.28 174 3.854(7) 77 C(28) -H(28A) [ 1] -> Cg(5) [ 1555.01] 2.79 -0.2327 0.1798 0.9558 2.2010 -2.77 5.99 152 3.673(6) 59 ---------- ---------------------------------------------- Min or Max 2.790 -2.770 5.99 174.00 3.673 77.00 [ 6545] = 1/2-X,-1/2+Y,1/2-Z [ 1555] = X,Y,Z |
2樓2011-06-15 15:07:32
ys851216
木蟲 (正式寫手)
- CMEI: 2
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1934.2
- 帖子: 573
- 在線: 174.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 849448
- 注冊(cè): 2009-09-16
- 性別: GG
- 專業(yè): 配位化學(xué)
★
drg1984(金幣+1): 謝謝回帖交流！ 2011-06-15 15:51:20
drg1984(金幣+1): 謝謝回帖交流！ 2011-06-15 15:51:20
|
你給的例子是計(jì)算Y-X...Cg(Pi-Ring)的 Analysis of Y-X...Cg(Pi-Ring) Interactions (X..Cg < 4.0 Ang. - Gamma < 30.0 Deg) ==================================================================================================================================== Y--X(I) Res(I) Cg(J) [ ARU(J)] X..Cg Transformed J-Plane P, Q, R, S X-Perp Gamma Y-X..Cg Y..Cg Y-X,Pi C(1) -Br(1) [ 1] -> Cg(5) [ 7566.01] 3.880(2) 0.2327-0.1798-0.9558 -13.0597 3.368 29.75 150.40(17) 5.593(5) 73.02 ---------- ---------------------------------------------- Min or Max 3.880 3.368 29.75 150.40 5.593 73.02 [ 7566] = 1/2-X,3/2-Y,1-Z |
3樓2011-06-15 15:09:09
baiyuefei
版主 (文學(xué)泰斗)
風(fēng)雪
- 應(yīng)助: 4642 (副教授)
- 貴賓: 46.969
- 金幣: 658582
- 散金: 11616
- 紅花: 995
- 沙發(fā): 81
- 帖子: 69420
- 在線: 13323.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 676696
- 注冊(cè): 2008-12-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 合成藥物化學(xué)
- 管轄: 有機(jī)交流
|
請(qǐng)問下高手，我的晶體是否存在C(28)-H(28A)***pi (benzene ring)作用呢？ 非晶體專業(yè)不是太明白麻煩高手了，鍵長(zhǎng)一般在多少范圍內(nèi)算是有C-H***pi 作用呢？有具體參考文獻(xiàn)嗎？我有重獎(jiǎng)給您，金幣不是問題啊再多加金幣給您可以嗎？審稿人讓我舉出C-H***pi 的鍵長(zhǎng)范圍是多少，可自己不會(huì)啊。審稿人給的信息如下： Characterization of non-covalent interactions. Authors should also provide more arguments on why they think that CH…N bond with almost 3 Å length is a strong one ("There is a strong intramolecular hydrogen bond, C(11)-H(11)…N(3) forming a six-membered ring."  . This interaction is commonly believed to be a weak one.This would be also interesting if authors can do some computational investigation to estimate the energy of this bond in order to classify its strength. To evaluate CH…N and CH… consider using Natural Bonds Orbitals (NBO) [4] and/or Atoms in Molecule (AIM) [5] approaches. Author suggested that C-H… criteria for this type of bond. They might use the results of recent analysis of 1154 proteins from PDB bank [6] work to support their statement about this type of interaction. |
4樓2011-06-15 15:56:10
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 baiyuefei 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級(jí)551，有科研經(jīng)歷 +3 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 070303一志愿西北大學(xué)學(xué)碩310找調(diào)劑 +6 | d如愿上岸 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
[考研] 一志愿武理材料305分求調(diào)劑 +5 | 想上岸的鯉魚 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑 總分331 +3 | ZY-05 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +3 | 妮妮ninicgb 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料，紡織，生物（0856、0710），化學(xué)招生啦 +3 | Eember. 2026-03-17 | 9/450 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 被我言中：新模板不強(qiáng)調(diào)格式了，假專家開始管格式了 +4 | beefly 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 中科院材料273求調(diào)劑 +4 | yzydy 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求老師收留調(diào)劑 +4 | jiang姜66 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 本科南京大學(xué)一志愿川大藥學(xué)327 +3 | 麥田耕者 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 297一志愿上交085600求調(diào)劑 +5 | 指尖八千里 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +3 | ?醬給調(diào)劑跪了 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機(jī)器學(xué)習(xí) 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +5 | 超級(jí)伊昂大王 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +8 | 困于星晨 2026-03-12 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 328化工專碩求調(diào)劑 +4 | 。，。，。，。i 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調(diào)劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 277求調(diào)劑 +4 | anchor17 2026-03-12 | 4/200 |
|