 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2490 | 回復: 9 | ||
| 本帖產生 1 個 1ST強帖 ，點擊這里進行查看 | ||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
[求助]
同個任務同樣的節(jié)點數(shù)VASP4.6能算，而VASP5.2不能
|
||
|
對24個原子的體系的結構優(yōu)化任務，256個節(jié)點，VASP4.6可以計算，但VASP5.2（自旋軌道耦合版本）計算得到段錯誤提示： forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred。 用ulimit -a查了下stack size：無限制。 以前小體系的時候測試過，發(fā)現(xiàn)兩個版本計算效率挺接近的，這次體系增大，同時增大節(jié)點數(shù)，發(fā)現(xiàn)很大差異，基本上VASP5.2很容易出現(xiàn)段錯誤提示。 看到wuli8版主的段錯誤一個貼，最終解決是在FLAG的選項中加入: -heap-arrays 64，而我的VASP5.2版本原來編譯時候已經加入了這項： FFLAGS = -FR -lowercase -assume byterecl -heap-arrays 64 -I/opt/intel/mkl/10.2.1.017/include/fftw 其它編譯參數(shù)： FC=mpiifort CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -Dkind8 -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \ -DMPI_BLOCK=8000 -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV SCA=-L/opt/intel/mkl/10.2.1.017/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp64 請教各位，編譯有沒問題，以前曾用這個VASP5.2計算過10個原子的自選軌道耦合，一直挺順利的。最近計算20原子的體系，總是出現(xiàn)問題。請大家?guī)兔聪率鞘裁磫栴}？ [ Last edited by zhang668 on 2011-6-15 at 22:22 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
309分085801求調劑
已經有7人回復
-
生物學308分求調劑（一志愿華東師大）
已經有3人回復
-
求調劑：一志愿：南京大學 專業(yè)：0705 總分320 ，本科985，四六級已過
已經有3人回復
-
環(huán)境工程 085701，267求調劑
已經有14人回復
-
308求調劑
已經有12人回復
-
求調劑：085600材料與化工，考材科基，總分319
已經有21人回復
-
311求調劑
已經有8人回復
-
294分080500材料科學與工程求調劑
已經有13人回復
-
288求調劑 一志愿哈工大 材料與化工
已經有19人回復
-
288資源與環(huán)境專碩求調劑，不限專業(yè)，有學上就行
已經有23人回復
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 請問DMA能不能測橡膠的彈性模量,該怎么測
已經有4人回復
- 不同數(shù)據(jù)，同樣的分析方法算剽竊嗎？
已經有13人回復
- vasp4.6收斂的結構在vasp5.2 計算不收斂
已經有7人回復
- （原創(chuàng)）MS4.4（LINUX版）詳細安裝步驟（同樣適用于高版本）
已經有5人回復
- 急問 現(xiàn)在哪里的計算中心有vasp5.2.12？
已經有6人回復
- 緊急求助vasp5.2 計算氧化鈰表面吸附遇到的若干問題
已經有4人回復
- 【求助】關于vasp5.2計算色散力
已經有5人回復
- 【求助】討論一下vasp4.6 和vasp5.2的計算速度
已經有8人回復
- 【求助】用vasp4.6計算GaAs的能帶結構
已經有18人回復
- 【求助】如何用vasp5.2中的DFPT方法算Born effective charge？
已經有11人回復
3樓2011-06-16 15:25:45
【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
youzhizhe(金幣+5): 謝謝交流。 2011-06-16 09:50:48
youzhizhe(1ST強帖+1): 謝謝交流。 2011-06-16 09:51:16
zhang668(金幣+3): 非常感謝詳細指導 2011-06-16 15:00:22
youzhizhe(金幣+5): 謝謝交流。 2011-06-16 09:50:48
youzhizhe(1ST強帖+1): 謝謝交流。 2011-06-16 09:51:16
zhang668(金幣+3): 非常感謝詳細指導 2011-06-16 15:00:22
|
1.查一查下OUTCAR里最后幾行的提示，是否進入了主循環(huán)計算？ 2.-heap-arrays 64 只是解決棧溢出問題，你只有那么點原子，考慮自旋也也不會產生此問題； 3.檢查一下你的編譯器的版本，INTEL 10.xxx編譯器本身有bug，會遇到一下意想不到的問題； 4.FC=mpiifort，這個是自己該的還是自動生成的？一般MPI編譯后，會建立個mpif90到ifort連接，即便并行編譯，F(xiàn)C=mpif90 或 ifort都可以； 5.你在做測試嗎？這么小的體系還用那么多個節(jié)點，并行效率很差，時間都浪費在CPU之間的通訊上了。你可以減少節(jié)點測試一下，或者串行試一下看看是否還有這個問題。 |
2樓2011-06-16 06:24:08
4樓2011-06-16 15:29:18
5樓2011-06-16 17:45:47
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿武理材料工程302調劑環(huán)化或化工 +11 | Doleres 2026-03-31 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[電化學] 070300化學調劑 +7 | 山頂見α 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
[考研] 267求調劑 +9 | uiybh 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京科技大學085601材料工程英一數(shù)二初試總分335求調劑 +4 | 雙馬尾痞老板2 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0805求調劑 +5 | 是水分 2026-03-31 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 080200學碩，機械工程專業(yè)277分，求帶走！ +4 | 瓶子PZ 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 362求調劑 +9 | 西南交材料專碩3 2026-03-31 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 生物學 296 求調劑 +7 | 朵朵- 2026-03-26 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 322求調劑 +10 | 宋明欣 2026-03-27 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 考研調劑 +5 | Sanmu-124 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703本科鄭州大學求調劑 +7 | nhj_ 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 283求調劑（080500） +14 | A child 2026-03-27 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南大學化學0703總分337求調劑 +6 | niko- 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 070305高分子化學與物理 304分求調劑 +12 | c297914 2026-03-28 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 085600，專業(yè)課化工原理，321分求調劑 +5 | 大饞小子 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 081200-11408-276學碩求調劑 +6 | 崔wj 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 352分 化工與材料 +5 | 海納百川Ly 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 265求調劑11408 +3 | 劉小鹿lu 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 復試調劑，一志愿南農083200食品科學與工程 +5 | XQTJZ 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 305求調劑 +5 | 哇盧卡庫 2026-03-26 | 5/250 |
|