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vetzcm木蟲 (正式寫手)
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[交流]
請(qǐng)問在做藥物分子對(duì)接時(shí)藥物分子結(jié)構(gòu)文件的準(zhǔn)備 已有5人參與
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| 大家好！我想請(qǐng)教下，如果做藥物分子與蛋白質(zhì)分子對(duì)接，目標(biāo)藥物分子自己繪制結(jié)構(gòu)時(shí)，是繪制成完整分子形式還是藥物的離子形式呢？?jī)烧哂杏绊憜�？麻煩了解的各位蟲友幫幫忙，十分感謝！ |
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vetzcm
2樓2011-06-30 13:28:23
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3樓2011-06-30 16:00:32
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4樓2011-07-01 07:03:04
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你好！我是做藥物分子反向?qū)樱玫氖蔷W(wǎng)上的數(shù)據(jù)庫(kù)搜索，這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)是TarFisDock,其中只需要我們提交自己研究分子的mol2文件就可以了，但我發(fā)現(xiàn)，藥物離子形式和完整分子形式的mol2文件提交后，會(huì)得到不一樣的結(jié)果，它們的靶蛋白有差別，energy score 也會(huì)不一樣。所以，我現(xiàn)在覺得，如果按照我們做實(shí)驗(yàn)的實(shí)際情況來看，比如藥物處理細(xì)胞，在細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮作用，藥物應(yīng)該是離子形式作用吧？ |
5樓2011-07-01 12:06:33
史東林
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6樓2011-07-01 22:43:58
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9樓2011-08-22 15:11:22
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