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1949stone榮譽(yù)版主 (知名作家)
海納百川
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[求助]
長(zhǎng)片段測(cè)序
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長(zhǎng)片段測(cè)序的方法有哪些好一點(diǎn)(性價(jià)比最好的) 可以提供幾個(gè)公司么? 片段大概有13000bp左右 沒(méi)有特殊結(jié)構(gòu) 就是線粒體的一部分 謝謝了 |

木蟲 (著名寫手)
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這個(gè)你可以打電話問(wèn)問(wèn)一些公司負(fù)責(zé)測(cè)序的業(yè)務(wù)員,有的業(yè)務(wù)員可能也不太明白則可以問(wèn)問(wèn)技術(shù)支持,現(xiàn)在測(cè)序也不是件難事,一般的準(zhǔn)確度我覺得差別不大,誤差應(yīng)該都在所規(guī)定的范圍內(nèi),就是服務(wù)質(zhì)量問(wèn)題,價(jià)格可能略有差異,我知道的一些公司,一般上海這邊的有invitrogen,上海生工,還有大連的TaKaRa公司,價(jià)格可以在他們的網(wǎng)站上看看。 |
木蟲 (正式寫手)
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生工和金斯瑞標(biāo)稱都是用的ABI-PRISM3730,號(hào)稱國(guó)際先進(jìn): 我的生工測(cè)序說(shuō)明,序列長(zhǎng)度5000bp做定點(diǎn)。 測(cè)序結(jié)果:與NCBI序列完全相同(定點(diǎn)突變除外)。 測(cè)序時(shí),由于熒光染料的干擾,測(cè)序結(jié)果在引物3'端后面的10至30個(gè),嚴(yán)重時(shí)可能達(dá)到70個(gè)以上堿基不一定能夠準(zhǔn)確判讀,需您根據(jù)自己的已知序列信息及測(cè)序彩圖作出判斷。 所用測(cè)序儀器為ABI-PRISM3730,測(cè)序試劑為BigDyeterminator v3.1。ABI公司對(duì)儀器的性能說(shuō)明為:正常情況下,除了開始約10至30個(gè)堿基,在650bp以內(nèi)可以達(dá)到98.5%以上的準(zhǔn)確率,但儀器及軟件有時(shí)也會(huì)發(fā)生錯(cuò)讀或漏讀堿基的情況,此時(shí)需要您自己判斷具體是什么堿基。所以,一般只有進(jìn)行正反鏈同時(shí)測(cè)序,在兩個(gè)序列完全吻合的情況下,才能確保所得序列100%可靠。單靠一個(gè)方向測(cè)序得到完全準(zhǔn)確的序列是幾乎不可能的,這是由儀器本身的性能指標(biāo)決定的。 正常情況下,一個(gè)測(cè)序反應(yīng)可以得到800bp以上,但一般在700bp以后的序列只能作為參考。 也可以考慮華大基因,以前聯(lián)系過(guò),¥50000測(cè)4M的基因組,性價(jià)比較高,還附帶基因組標(biāo)注,大片段是他們的強(qiáng)項(xiàng)。 |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (正式寫手)
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曾經(jīng)有一段時(shí)間都是讓英駿(現(xiàn)在的英杰公司)測(cè)序,后來(lái)發(fā)現(xiàn)他們有時(shí)候的速度實(shí)在是太慢了,F(xiàn)在都是在美吉測(cè),感覺還不錯(cuò)。 華大基因的全基因組測(cè)序應(yīng)該是比較可靠的吧。 但我覺得5K也不算太長(zhǎng),所以一般的公司都能測(cè)的。 |
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