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xingjunhao金蟲 (正式寫手)
菜鳥
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[求助]
說藥物分子的P1部分是不什么意思？
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| 說藥物分子的P1部分是不什么意思？是說藥物有一個(gè)平面結(jié)構(gòu)嗎？ |
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shaojiyeah
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
karl2100(金幣+1): 謝謝應(yīng)助！ 2011-07-11 00:12:26
xingjunhao(金幣+2): 2011-07-11 09:25:40
jiangchunyong(金幣+1): 謝謝 2011-07-11 13:06:35
karl2100(金幣+1): 謝謝應(yīng)助！ 2011-07-11 00:12:26
xingjunhao(金幣+2): 2011-07-11 09:25:40
jiangchunyong(金幣+1): 謝謝 2011-07-11 13:06:35
| 比如：分子中有2個(gè)疏水中心(H1,H2)、疏水側(cè)鏈H3、2個(gè)氫鍵受體(A1,A2)和極性原子(P)。H1和A1位于疏水口袋I中,A1與β-Cys241存在氫鍵作用；H2和H3位于疏水口袋II中；P位于極性區(qū)域IV中,與α-Ser178或α-Thr181形成氫鍵；A2靠近loop區(qū)的β-Ala250的骨架-NH。同時(shí)由于極性區(qū)域V可以作為潛在的結(jié)合部位,因而在A2和loop之間,還假設(shè)存在另一個(gè)氫鍵受體點(diǎn)A3以同loop區(qū)中的骨架-NH形成氫鍵。其中H1和A1組成了平面P1,H2、H3以及P構(gòu)成平面P2,但是平面P1-P2之間存在42～60的夾角。 |
2樓2011-07-10 23:00:53
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