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rulongxu

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[求助] 溶劑中過渡態(tài)查找

請(qǐng)問在溶劑中進(jìn)行過渡態(tài)查找應(yīng)該用什么方法？非常感謝！

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1樓 2011-07-12 08:46:04

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獨(dú)孤狼

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
gmy1990(金幣+2): 非常感謝你對(duì)論壇的貢獻(xiàn)，獎(jiǎng)勵(lì)一下！ 2011-07-12 10:54:42

和氣相中一樣，加上溶劑修正即可

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回復(fù)此樓

輪回的過往，注定的未來；獨(dú)孤的行者，孤獨(dú)的路途……

2樓2011-07-12 10:12:44

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引用回帖:

Originally posted by 獨(dú)孤狼 at 2011-07-12 10:12:44:
和氣相中一樣，加上溶劑修正即可

我做的是非均相反應(yīng)。催化劑為固體，氯仿為溶劑。運(yùn)行之后出錯(cuò)。
# m052x/sto-3g scrf=(iefpcm,solvent=8,read) opt=(calcfc,qst2) geom=connectivity

reactants

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C                -2.20850800 -4.53359100 1.00112900
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H                2.87892600 -2.33682500 1.66489600
H                2.62331500 -3.62887500 -0.38354800
H                2.60691300 -2.84047800 -1.97929100
H                0.34739600 -2.55282400 0.06072800
H                0.34169800 -3.76748800 -1.24033600
H                -0.85838100 -1.61043900 -1.84004600
H                0.46829400 -2.03495900 -2.94815800
H                -0.77072500 0.97991600 -1.75152300
H                0.82685400 1.75251900 -1.89012500
H                0.15870100 0.83729100 -3.26281500
H                2.18306300 1.90996500 -1.27065000
H                4.25901800 0.32240300 0.31851600
H                6.00421600 3.70702600 0.77867000
H                5.54969900 2.33115500 1.81226200
H                6.48006100 2.05423000 0.32031100

1 2 1.0 14 1.0 15 1.0 16 1.0
2 3 1.0 4 1.0 17 1.0
3 18 1.0 19 1.0 20 1.0
4 5 2.0 9 1.0
5 6 1.0 21 1.0
6 7 2.0 22 1.0
7 8 1.0 10 1.0
8 9 2.0 23 1.0
9 24 1.0
10 11 1.0 12 1.0 13 1.0
11
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13 25 1.0
14
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24
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26 27 1.0 40 1.0 41 1.0 42 1.0
27 28 1.0 29 1.0 33 1.0
28 43 1.0 44 1.0 45 1.0
29 30 1.0 46 1.0 47 1.0
30 31 1.0 48 1.0 49 1.0
31 32 1.0 50 1.0 51 1.0
32 33 2.0 34 1.0
33 35 1.0
34 52 1.0 53 1.0 54 1.0
35 36 2.0 55 1.0
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38 57 1.0 58 1.0 59 1.0
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57
58
59

出錯(cuò)：try using 3 structures as input for qst transition state research
請(qǐng)多多幫忙，非常感謝！

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3樓2011-07-12 11:07:43

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【答案】應(yīng)助回帖

rulongxu(金幣+5): 很好。 2011-07-12 15:26:05

qst2并不意味著隨便拉兩個(gè)構(gòu)象就能找過渡態(tài)，最起碼你要想想這個(gè)體系該怎么反應(yīng)吧。

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輪回的過往，注定的未來；獨(dú)孤的行者，孤獨(dú)的路途……

4樓2011-07-12 11:45:13

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rulongxu

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Originally posted by 獨(dú)孤狼 at 2011-07-12 11:45:13:
qst2并不意味著隨便拉兩個(gè)構(gòu)象就能找過渡態(tài)，最起碼你要想想這個(gè)體系該怎么反應(yīng)吧。

那應(yīng)該怎么放啊？請(qǐng)指教，非常感謝！

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5樓2011-07-12 14:36:50

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★ ★ ★
gmy1990(金幣+3): 2011-07-12 16:34:40

那是你的課題，你該自己想過該怎么做吧~~現(xiàn)在紙上劃一下整個(gè)體系的電子推動(dòng)作用，或者參照各種文獻(xiàn)之類的把可能的機(jī)理找出來，然后你再考慮該怎么算機(jī)理，找過渡態(tài)……

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6樓2011-07-12 15:16:29

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引用回帖:

Originally posted by 獨(dú)孤狼 at 2011-07-12 15:16:29:

好的。非常感謝。

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7樓2011-07-12 15:25:41

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