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流感病毒跨膜通道調(diào)控機(jī)制研究獲進(jìn)展 已有1人參與
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來自上海交大生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院、美國弗萊德?哈欽森癌癥研究中心的研究人員在在A型流感病毒M2跨膜蛋白質(zhì)子通道分子調(diào)控機(jī)制的研究中取得重要進(jìn)展，成果發(fā)表在化學(xué)領(lǐng)域著名學(xué)術(shù)期刊《美國化學(xué)會(huì)志》（Journal of the American Chemical Society）上。 文章的第一作者是上海交大生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院的博士生顧若虛，上海交大的魏冬青教授及美國弗萊德?哈欽森癌癥研究中心的Limin Angela Liu為這篇文章的共同通訊作者。魏冬青教授的主要研究方向?yàn)樯镄畔W(xué)和生物物理學(xué)，近年來主要開展結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)和計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)的研究工作。至今發(fā)表SCI文章100多篇，被累積引用2422次。 2008年《自然》（Nature）雜志曾同時(shí)發(fā)表了兩篇文章，報(bào)道了A型流感病毒M2跨膜蛋白質(zhì)子通道的結(jié)構(gòu)，分別由X-ray和NMR獲得，但是配體結(jié)合位點(diǎn)則完全不同，一個(gè)在通道中間（P-binding site），而另外一個(gè)在通道表面靠近C端的位置（S-binding site)，這引發(fā)了諸多的科學(xué)爭議。 顧若虛博士在魏冬青教授的指導(dǎo)下采用分子動(dòng)力學(xué)和自由能計(jì)算的方法計(jì)算了通道的抑制劑金剛乙胺結(jié)合到離子通道兩個(gè)位點(diǎn)處的自由能，發(fā)現(xiàn)通道中間的結(jié)合位點(diǎn)比通道表面的結(jié)合位點(diǎn)從能量上更加穩(wěn)定，但需要跨越的能壘遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于結(jié)合到通道表面的位點(diǎn)，因此，通道中間的結(jié)合位點(diǎn)是熱力學(xué)位點(diǎn)，對(duì)抑制通道起主要作用。通道表面的結(jié)合位點(diǎn)是動(dòng)力學(xué)位點(diǎn)，藥物更容易結(jié)合，同時(shí)也更容易解離。這項(xiàng)研究工作解釋了上述看似相互矛盾的實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象，同時(shí)有助于闡釋藥物調(diào)控離子通道的機(jī)理，對(duì)于藥物設(shè)計(jì)有一定的指導(dǎo)作用。（來源：生物通 何嬙） |
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