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qingtingzhe銀蟲 (正式寫手)
步行者
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[求助]
求助用DS進行同源建模的高手
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求助用DS進行同源建模的高手： 1 我在進行同源建模時，在將目標(biāo)序列和模板比對時，教程讓用uniref90比對，但DS 中不帶這個數(shù)據(jù)庫，不知哪位高手知道怎么添加這個數(shù)據(jù)庫？ 2 我在序列比對結(jié)束后，用modeler構(gòu)建3D模型時，出現(xiàn)如下問題，請幫解答一下： Error Messages Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990001.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990002.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990003.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990004.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990005.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Engine failed to generate any model. Please check MODELER log file (modeler.log). 0 28 Traceback (most recent call last): File "modeler.py", line 44, in ? m.make() File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 99, in make self.homcsr(exit_stage) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 426, in homcsr self.check_alignment(aln) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 408, in check_alignment aln.check() File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\alignment.py", line 191, in check self.check_structure_structure(io=io) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\alignment.py", line 200, in check_structure_structure return f(self.modpt, io.modpt, self.env.libs.modpt, eqvdst) _modeller.ModellerError: check_a_282E> Unable to read structural information for alignment sequence: 5 2B1XA This command requires structures. [ Last edited by ghcacj on 2011-8-17 at 09:34 ] |
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2樓2011-08-18 12:46:18
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3樓2011-08-18 21:05:52
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