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robert-xn銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
轉錄起始位點與起始密碼子間的距離
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| 麻煩大家,想問問轉錄起始位點與起始密碼子的距離是固定的么,如果不是,大家見過的最大的距離是多少呢?謝謝大家了 |
【分子生物】EPI帖 |

銀蟲 (小有名氣)

木蟲 (正式寫手)
銀蟲 (小有名氣)

木蟲 (正式寫手)
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我首先要說,對于啟動子和轉錄起始位點之間的距離,我看到的文獻明確提出這一點的相對較少,只看到過一篇文獻提到過牛GDF5基因轉錄起始位點位于翻譯起始密碼子ATG上游-359 bp位置,也許是因為我個人專業(yè)不是相關方向。我了解到的情況中,這個距離在幾十到100多bp的情況較多。 另外,我可以給你說一下我昨天說到的更長的情況。我以前做過一段時間基因組方面的課題,當然只是針對我目前的這個模式物種,我的模式物種屬于真核單細胞生物。昨天說過大多數(shù)情況在50bp到100多bp,曾經(jīng)預測得到不止一條基因的啟動子和轉錄起始位點之間具有200甚至更長的距離,但是目前沒有做過實驗驗證。 印象中有文獻提到轉錄起點和起始密碼子之間距離可以相當長,甚至在這中間序列中可能含有有內(nèi)含子和外顯子。 如果這點對你很重要,建議針對你得到的基因進行5‘RACE實驗驗證。 |
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