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robert-xn銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄起始位點與起始密碼子間的距離
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| 麻煩大家，想問問轉(zhuǎn)錄起始位點與起始密碼子的距離是固定的么，如果不是，大家見過的最大的距離是多少呢？謝謝大家了 |
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 【分子生物】EPI帖 |
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2樓2011-08-18 18:09:54
csdyg
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【答案】應(yīng)助回帖
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西瓜(金幣+5, MolEPI+1): Good! 2011-08-19 10:02:25
robert-xn(金幣+3): 得到答案 2011-08-19 17:48:02
西瓜(金幣+5, MolEPI+1): Good! 2011-08-19 10:02:25
robert-xn(金幣+3): 得到答案 2011-08-19 17:48:02
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這個不是固定的，有的物種基因具有單轉(zhuǎn)錄起始位點，有的基因在起始密碼子上游具有多個轉(zhuǎn)錄起始位點串聯(lián)的結(jié)構(gòu) 我的模式物種中的基因轉(zhuǎn)錄起始位點和起始密碼子之間的距離也不固定，大多在50bp到100多bp 甚至看到更長的，但是屬于預(yù)測結(jié)果，還沒有經(jīng)過實驗驗證 |
3樓2011-08-18 19:36:56
robert-xn
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4樓2011-08-19 09:08:20
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西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 很好！ 2011-08-19 23:26:48
西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 很好！ 2011-08-19 23:26:55
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西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 很好！ 2011-08-19 23:26:55
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我首先要說，對于啟動子和轉(zhuǎn)錄起始位點之間的距離，我看到的文獻明確提出這一點的相對較少，只看到過一篇文獻提到過牛GDF5基因轉(zhuǎn)錄起始位點位于翻譯起始密碼子ATG上游-359 bp位置，也許是因為我個人專業(yè)不是相關(guān)方向。我了解到的情況中，這個距離在幾十到100多bp的情況較多。 另外，我可以給你說一下我昨天說到的更長的情況。我以前做過一段時間基因組方面的課題，當然只是針對我目前的這個模式物種，我的模式物種屬于真核單細胞生物。昨天說過大多數(shù)情況在50bp到100多bp，曾經(jīng)預(yù)測得到不止一條基因的啟動子和轉(zhuǎn)錄起始位點之間具有200甚至更長的距離，但是目前沒有做過實驗驗證。 印象中有文獻提到轉(zhuǎn)錄起點和起始密碼子之間距離可以相當長，甚至在這中間序列中可能含有有內(nèi)含子和外顯子。 如果這點對你很重要，建議針對你得到的基因進行5‘RACE實驗驗證。 |
5樓2011-08-19 21:14:14
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8樓2011-08-20 09:35:13
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9樓2011-08-22 10:40:36
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