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robert-xn銀蟲 (小有名氣)
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[求助]
轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)與起始密碼子間的距離
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| 麻煩大家，想問問轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)與起始密碼子的距離是固定的么，如果不是，大家見過的最大的距離是多少呢？謝謝大家了 |
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2樓2011-08-18 18:09:54
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【答案】應(yīng)助回帖
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西瓜(金幣+5, MolEPI+1): Good! 2011-08-19 10:02:25
robert-xn(金幣+3): 得到答案 2011-08-19 17:48:02
西瓜(金幣+5, MolEPI+1): Good! 2011-08-19 10:02:25
robert-xn(金幣+3): 得到答案 2011-08-19 17:48:02
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這個(gè)不是固定的，有的物種基因具有單轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)，有的基因在起始密碼子上游具有多個(gè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)串聯(lián)的結(jié)構(gòu) 我的模式物種中的基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)和起始密碼子之間的距離也不固定，大多在50bp到100多bp 甚至看到更長(zhǎng)的，但是屬于預(yù)測(cè)結(jié)果，還沒有經(jīng)過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證 |
3樓2011-08-18 19:36:56
robert-xn
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4樓2011-08-19 09:08:20
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【答案】應(yīng)助回帖
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西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 很好！ 2011-08-19 23:26:48
西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 很好！ 2011-08-19 23:26:55
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西瓜(金幣+5, MolEPI+1): 很好！ 2011-08-19 23:26:55
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我首先要說，對(duì)于啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)之間的距離，我看到的文獻(xiàn)明確提出這一點(diǎn)的相對(duì)較少，只看到過一篇文獻(xiàn)提到過牛GDF5基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)位于翻譯起始密碼子ATG上游-359 bp位置，也許是因?yàn)槲覀�(gè)人專業(yè)不是相關(guān)方向。我了解到的情況中，這個(gè)距離在幾十到100多bp的情況較多。 另外，我可以給你說一下我昨天說到的更長(zhǎng)的情況。我以前做過一段時(shí)間基因組方面的課題，當(dāng)然只是針對(duì)我目前的這個(gè)模式物種，我的模式物種屬于真核單細(xì)胞生物。昨天說過大多數(shù)情況在50bp到100多bp，曾經(jīng)預(yù)測(cè)得到不止一條基因的啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)之間具有200甚至更長(zhǎng)的距離，但是目前沒有做過實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。 印象中有文獻(xiàn)提到轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)和起始密碼子之間距離可以相當(dāng)長(zhǎng)，甚至在這中間序列中可能含有有內(nèi)含子和外顯子。 如果這點(diǎn)對(duì)你很重要，建議針對(duì)你得到的基因進(jìn)行5‘RACE實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。 |
5樓2011-08-19 21:14:14
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9樓2011-08-22 10:40:36
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