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關(guān)于分子在表面模擬的若干問題
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假設(shè)CO2分子在Ni（110）表面的吸附模擬，希望能夠回答以下幾個問題： 1 CO2在與Ni（110）表面之間的距離怎么確定？是隨便選擇一個距離，還是有其具體值？ 2 添加CO2分子的時候，需要將其鍵修改成雙鍵或者離域鍵，又或者直接加上不用修改（在materials studio的castep練習(xí)中，在模擬CO在Pt表面的吸附時，直接加了C和O原子，沒有改變其鍵的種類）？ 3在構(gòu)型優(yōu)化中，是把優(yōu)化后的CO2分子放在優(yōu)化后的Ni表面，還是將未優(yōu)化的CO2放在未優(yōu)化的Ni表面，然后優(yōu)化？ 4 在優(yōu)化時，對稱操作的作用意義在哪里？ 還望各位多多交流，小弟不甚感激！ |
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2樓2011-08-29 23:57:49
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franch(金幣+3): 謝謝回帖交流 2011-08-30 11:13:02
franch(金幣+3): 謝謝回帖交流 2011-08-30 11:13:02
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假設(shè)CO2分子在Ni（110）表面的吸附模擬，希望能夠回答以下幾個問題： 1 CO2在與Ni（110）表面之間的距離怎么確定？是隨便選擇一個距離，還是有其具體值？ 這個只能大致估計，CO2以分子態(tài)吸附，比較弱，吸附原子與表面原子間距可考慮為范德華半徑和；注意各種可能吸附構(gòu)型！如果一別C=O鍵打開后吸附，距離可能稍短點； 2 添加CO2分子的時候，需要將其鍵修改成雙鍵或者離域鍵，又或者直接加上不用修改（在materials studio的castep練習(xí)中，在模擬CO在Pt表面的吸附時，直接加了C和O原子，沒有改變其鍵的種類）？ 這個不重要，距離是關(guān)鍵； 3在構(gòu)型優(yōu)化中，是把優(yōu)化后的CO2分子放在優(yōu)化后的Ni表面，還是將未優(yōu)化的CO2放在未優(yōu)化的Ni表面，然后優(yōu)化？ 都可以。一般先優(yōu)化表面，在放吸附物優(yōu)化，順帶考察吸附對表面的影響； 4 在優(yōu)化時，對稱操作的作用意義在哪里？ 省時間+你自己想要的構(gòu)型 |
3樓2011-08-30 06:30:08
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【答案】應(yīng)助回帖
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zhxbaig(金幣+10): 謝謝您的回答 2011-08-30 08:19:36
franch(金幣+2): 謝謝回帖交流 2011-08-30 11:14:00
zhxbaig(金幣+2): 謝謝 2011-11-13 16:41:44
zhxbaig(金幣+10): 謝謝您的回答 2011-08-30 08:19:36
franch(金幣+2): 謝謝回帖交流 2011-08-30 11:14:00
zhxbaig(金幣+2): 謝謝 2011-11-13 16:41:44
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第一，二氧化碳與鎳之間有一個大概距離可以在文獻(xiàn)里查到，用這個距離在優(yōu)化是比較快，而且分子不容易變形。 第二，我個人認(rèn)為這個不需要修改，直接加就可以了。 第三，我一般在優(yōu)化的時候，都是先加后優(yōu)化，不過你也可以，先優(yōu)化，再加，在優(yōu)化 。 第四，在優(yōu)化時對稱操作可以使分子更快的找到能量最低點，達(dá)到穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，節(jié)約時間。 以上是我自己的看法，如有不對還望各位斧正。 |
4樓2011-08-30 07:18:32
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7樓2011-08-30 13:40:47
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8樓2011-08-30 17:59:03
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9樓2011-08-30 19:27:13
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10樓2011-08-30 19:27:45
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