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魏將何在新蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
pull code 輸出文件含義
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第一次用pull code 模塊，輸出的pullx.xvg里面的東西不是很清楚，望解答。 想算一下離子移動(dòng)過(guò)程的PMF pullx.xvg一部分如下 299.9000 4.96089 2.42961 299.9200 4.96114 2.44277 299.9400 4.9615 2.45399 299.9600 4.9618 2.45783 299.9800 4.96204 2.4546 300.0000 4.96218 2.44828 第一列時(shí)間，第二列似乎是參考組的Z坐標(biāo)，第三列就不知道是什么了 mdp中的pull代碼如下： pull = umbrella pull_geometry = position pull_dim = N N Y pull_ngroups = 1 pull_group0 = NA2 pull_group1 = CL pull_k1 = 100 pull_vec1 = 0 0 1 pullrate1 = 0 0 0.2 pull_init1 = 0 0 6 pull_start = no 我這樣寫(xiě)有什么問(wèn)題嗎？ |
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