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[求助]
AUTODOCK對(duì)接步驟求助(附圖）
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最近學(xué)習(xí)AUTODOCK軟件的使用，遇到以下幾個(gè)問題： 1.大分子和小分子相隔太遠(yuǎn)，所建盒子無(wú)法把兩者都包括到一起。如圖1. 2.完成自動(dòng)對(duì)接前的dpf文件設(shè)置后，進(jìn)行對(duì)接。彈出下圖2，無(wú)法完成對(duì)接。想通過Browse按鈕進(jìn)行改變，結(jié)果根本找不到相應(yīng)的dpf文件。（包括前幾步在內(nèi),每次設(shè)置好的文件圖標(biāo)都如圖3所示）。 [ Last edited by 可米kemi on 2011-9-5 at 23:08 ] |
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 分子對(duì)接 |
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3樓2011-09-06 09:11:20
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-09-07 14:30:08
可米kemi(金幣+5): 這樣，那個(gè)目標(biāo)路徑應(yīng)該在documents and settings還是在python25里呢？謝謝。 2011-09-08 09:27:48
可米kemi(金幣+10): 多謝指導(dǎo)，我按照你說的果然有效。然后，第一個(gè)問題，我拿事先用GAUSSIAN計(jì)算過的分子帶進(jìn)去算也解決了。 2011-09-14 08:51:09
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-09-07 14:30:08
可米kemi(金幣+5): 這樣，那個(gè)目標(biāo)路徑應(yīng)該在documents and settings還是在python25里呢？謝謝。 2011-09-08 09:27:48
可米kemi(金幣+10): 多謝指導(dǎo)，我按照你說的果然有效。然后，第一個(gè)問題，我拿事先用GAUSSIAN計(jì)算過的分子帶進(jìn)去算也解決了。 2011-09-14 08:51:09
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按照我的一點(diǎn)點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)，你的路徑有問題，我認(rèn)為。 啟動(dòng)ADT要在目標(biāo)路徑里，而不是通過快捷方式，而且你所用的受體配體文件等所有準(zhǔn)備文件也要在這個(gè)路徑里的 希望對(duì)你有所提示 |
4樓2011-09-06 16:18:35
5樓2011-09-14 08:58:29
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