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PSA專家顧問 (著名寫手)
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[求助]
用pymol顯示氫鍵的問題,在線等,急需解決,謝謝!
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對接后的PDB文件用pymol顯示不出ligplus能顯示出來的那個氫鍵(ALA173),而pymol顯示出了ligplus不顯示的氫鍵(TYR179)。我想要蛋白的二級結構那樣子的圖,所以想用pymol作圖,另外我用MVD,ds也顯示了結果和pymol一樣。我需要用ALA173這個來說明問題,我猜有可能是氫鍵的距離問題,這個鍵長是3.26,我可以通過什么設置來改變pymol的cutoff嗎?請大家指導 我現(xiàn)在把PDB文件傳上來,希望能夠得到你們的幫助,謝謝! 順祝中秋快樂 |
pymol/VMD/Origin |
專家顧問 (著名寫手)
金蟲 (小有名氣)
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