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PSA專(zhuān)家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
用pymol顯示氫鍵的問(wèn)題，在線(xiàn)等，急需解決，謝謝！
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對(duì)接后的PDB文件用pymol顯示不出ligplus能顯示出來(lái)的那個(gè)氫鍵（ALA173），而pymol顯示出了ligplus不顯示的氫鍵（TYR179）。我想要蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)那樣子的圖，所以想用pymol作圖，另外我用MVD，ds也顯示了結(jié)果和pymol一樣。我需要用ALA173這個(gè)來(lái)說(shuō)明問(wèn)題，我猜有可能是氫鍵的距離問(wèn)題，這個(gè)鍵長(zhǎng)是3.26，我可以通過(guò)什么設(shè)置來(lái)改變pymol的cutoff嗎？請(qǐng)大家指導(dǎo) 我現(xiàn)在把PDB文件傳上來(lái)，希望能夠得到你們的幫助，謝謝！ 順祝中秋快樂(lè) |
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 pymol/VMD/Origin |
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- 請(qǐng)高手指導(dǎo)，我的pymol為何不顯示氫鍵
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2樓2011-09-09 01:21:17
PSA
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3樓2011-09-09 08:37:34
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4樓2011-09-17 19:12:57
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5樓2011-09-17 20:08:17
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