 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1613 | 回復(fù): 8 | |||
mika金蟲 (正式寫手)
納米寶貝
|
[交流]
siesta3.1并行 已有3人參與
|
|
我是個(gè)新手，試著編譯了新版本3.1，我沒有在總的服務(wù)器上編譯，只是在我自己的端口編譯了一下，configure之后就自動(dòng)出來(lái)一個(gè)arch.make文件，其中我只修改FC=mpif90這一句（整個(gè)arch.make見最后），但是在運(yùn)行mpirun的時(shí)候，出現(xiàn)如下錯(cuò)誤： No species found!!! ERROR STOP from Node: 0 abort: Fortran Abort Called No species found!!! ERROR STOP from Node: 0 abort: Fortran Abort Called No species found!!! ERROR STOP from Node: 0 abort: Fortran Abort Called -------------------------------------------------------------------------- mpirun noticed that the job aborted, but has no info as to the process that caused that situation. -------------------------------------------------------------------------- 但是我看了看程序還是在運(yùn)行，在.out文件的開始寫著這樣的內(nèi)容，我用了mpirun怎么還是serial version呢？ Siesta Version: siesta-3.1 Architecture : x86_64-unknown-linux-gnu--unknown Compiler flags: mpif90 -g -O2 SERIAL version Siesta Version: siesta-3.1 Architecture : x86_64-unknown-linux-gnu--unknown Compiler flags: mpif90 -g -O2 SERIAL version * Running in serial mode >> Start of run: 23-SEP-2011 10:45:13 arch.make如下： # # This file is part of the SIESTA package. # # Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid: # E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal # and J.M.Soler, 1996- . # # Use of this software constitutes agreement with the full conditions # given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users. # .SUFFIXES: .SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90 SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown FPP= FPP_OUTPUT= FC=mpif90 RANLIB=ranlib SYS=nag SP_KIND=4 DP_KIND=8 KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND) FFLAGS=-g -O2 FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT LDFLAGS= ARFLAGS_EXTRA= FCFLAGS_fixed_f= FCFLAGS_free_f90= FPPFLAGS_fixed_F= FPPFLAGS_free_F90= BLAS_LIBS=libblas.a LAPACK_LIBS=dc_lapack.a liblapack.a BLACS_LIBS= SCALAPACK_LIBS= COMP_LIBS=dc_lapack.a liblapack.a libblas.a NETCDF_LIBS= NETCDF_INTERFACE= LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS) #SIESTA needs an F90 interface to MPI #This will give you SIESTA's own implementation #If your compiler vendor offers an alternative, you may change #to it here. MPI_INTERFACE= MPI_INCLUDE= #Dependency rules are created by autoconf according to whether #discrete preprocessing is necessary or not. .F.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F) $< .F90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $< .f.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f) $< .f90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90) $< |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)一志愿985，分?jǐn)?shù)349求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
生物學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
求調(diào)劑院校信息
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085600材料與化工306
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
286求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
328求調(diào)劑，英語(yǔ)六級(jí)551，有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿北京化工大學(xué)070300 學(xué)碩336求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
286分人工智能專業(yè)請(qǐng)求調(diào)劑愿意跨考！
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
資源與環(huán)境 調(diào)劑申請(qǐng)(333分)
已經(jīng)有5人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- （求大神）SIESTA %block Zmatrix 疑問
已經(jīng)有2人回復(fù)
- siesta基組優(yōu)化問題
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 使用gfortran和openmpi并行編譯SIESTA(原創(chuàng))
已經(jīng)有2人回復(fù)
- siesta運(yùn)行出現(xiàn)問題，Error in Cholesky factorisation in cdiag，原子間距過(guò)小，求助
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 強(qiáng)勢(shì)增強(qiáng)CASTEP輸出的工具：check2xsf （Windows版）
已經(jīng)有165人回復(fù)
- 用MPIF90編譯后的Siesta并行出錯(cuò)，串行沒事……
已經(jīng)有1人回復(fù)
- Siesta3.1識(shí)別不了NetCDF？ 如何設(shè)置INTERFACE?
已經(jīng)有3人回復(fù)
- siesta 3.1 畫電荷密度圖
已經(jīng)有4人回復(fù)
- SIESTA中能帶文件*.bands的處理
已經(jīng)有49人回復(fù)
- 請(qǐng)教，為什么會(huì)出現(xiàn)這樣的情況？謝謝大家
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【分享】《納米模擬軟件》(v11.2.2.3069【已搜索無(wú)重復(fù)】
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【其他】【誠(chéng)聘版主】第一性原理版歡迎您的加入
已經(jīng)有62人回復(fù)
- 【分享】第一性原理版斑竹招新（非誠(chéng)勿擾）
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 【誠(chéng)聘版主】第一性原理版歡迎您的加入
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【誠(chéng)聘版主】第一性原理版歡迎您的加入
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【原創(chuàng)】siesta 3.0成功編譯的arch.make
已經(jīng)有26人回復(fù)
- 【分享】量化軟件 - 輸運(yùn)相關(guān) (zz)
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 【分享】世界上講述電子結(jié)構(gòu)計(jì)算的最權(quán)威和實(shí)用的網(wǎng)站
已經(jīng)有22人回復(fù)
identation
金蟲 (著名寫手)
- 1ST強(qiáng)帖: 16
- 應(yīng)助: 46 (小學(xué)生)
- 貴賓: 2.516
- 金幣: 253.4
- 散金: 2603
- 紅花: 44
- 帖子: 1283
- 在線: 500.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 842155
- 注冊(cè): 2009-09-06
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
gzqdyouxia(金幣+2): 謝謝提示 2011-09-23 12:04:28
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
gzqdyouxia(金幣+2): 謝謝提示 2011-09-23 12:04:28
|
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2420318&fpage=1 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1930406&fpage=1 這兩個(gè)是教程 |
2樓2011-09-23 11:25:50
guohuazhong
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
- 1ST強(qiáng)帖: 1
- 應(yīng)助: 52 (初中生)
- 貴賓: 0.032
- 金幣: 35131.5
- 散金: 5
- 紅花: 19
- 沙發(fā): 1
- 帖子: 3924
- 在線: 885.6小時(shí)
- 蟲號(hào): 550098
- 注冊(cè): 2008-04-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
3樓2011-09-23 15:17:36
souledge
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
- 應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
- 金幣: 11306.4
- 散金: 1123
- 紅花: 108
- 帖子: 2814
- 在線: 916.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 941486
- 注冊(cè): 2010-01-12
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
- 管轄: 第一性原理
4樓2011-09-23 16:40:52
mika
金蟲 (正式寫手)
納米寶貝
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 992.4
- 散金: 76
- 帖子: 401
- 在線: 121小時(shí)
- 蟲號(hào): 836617
- 注冊(cè): 2009-08-29
- 性別: MM
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
5樓2011-09-23 17:06:03
mika
金蟲 (正式寫手)
納米寶貝
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 992.4
- 散金: 76
- 帖子: 401
- 在線: 121小時(shí)
- 蟲號(hào): 836617
- 注冊(cè): 2009-08-29
- 性別: MM
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
6樓2011-09-23 17:07:02
mika
金蟲 (正式寫手)
納米寶貝
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 992.4
- 散金: 76
- 帖子: 401
- 在線: 121小時(shí)
- 蟲號(hào): 836617
- 注冊(cè): 2009-08-29
- 性別: MM
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
7樓2011-09-23 17:07:30
souledge
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +174 - 1ST強(qiáng)帖: 19
- 應(yīng)助: 303 (大學(xué)生)
- 金幣: 11306.4
- 散金: 1123
- 紅花: 108
- 帖子: 2814
- 在線: 916.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 941486
- 注冊(cè): 2010-01-12
- 專業(yè): 結(jié)構(gòu)陶瓷
- 管轄: 第一性原理
8樓2011-09-23 18:05:02
mika
金蟲 (正式寫手)
納米寶貝
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 金幣: 992.4
- 散金: 76
- 帖子: 401
- 在線: 121小時(shí)
- 蟲號(hào): 836617
- 注冊(cè): 2009-08-29
- 性別: MM
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
9樓2011-09-24 19:01:25
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 mika 的主題更新
| 9 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)071000，求調(diào)劑 +4 | 沿岸有貝殼6 2026-03-21 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 化學(xué)工程321分求調(diào)劑 +18 | 大米飯！ 2026-03-15 | 22/1100 |
|
|
|
[考研] 一志愿南大，0703化學(xué)，分?jǐn)?shù)336，求調(diào)劑 +3 | 收到VS 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 工科0856求調(diào)劑 +3 | 沐析汀汀 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +3 | 勇敢的小吳 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑0854 +3 | assdll 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856材料專碩353求調(diào)劑 +3 | NIFFFfff 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名 +5 | 脫穎而出 2026-03-16 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | wyyyqx 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +10 | 冷笙123 2026-03-17 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境專碩，總分308求調(diào)劑 +3 | 墨墨漠 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22408 344分 求調(diào)劑 一志愿 華電計(jì)算機(jī)技術(shù) +4 | solanXXX 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 330求調(diào)劑 +4 | 小材化本科 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿武漢理工材料工程專碩調(diào)劑 +9 | Doleres 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
|
[考研]
 295復(fù)試調(diào)劑
+8
|
簡(jiǎn)木ChuFront 2026-03-19 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 295材料求調(diào)劑，一志愿武漢理工085601專碩 +5 | Charlieyq 2026-03-19 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)求調(diào)劑 +4 | Stella_Yao 2026-03-20 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +7 | 困于星晨 2026-03-17 | 9/450 |
|