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[求助] 關(guān)于FEP 收斂的問題

最近在做NAMD FEP的tutorial,有點(diǎn)不太明白的地方是如何確定FEP模擬是收斂的。教程上說了下面這段話，后面那段看不懂是什么意思。

Probing the convergence properties of the simulation

We can assess convergence of the free energy calculation by monitoring the time-evolution
of ∆G(λ) for every individual λ-state and the overlap of configurational ensembles embod-
ied in their density of states, P0 [∆U (x)] and P1 [∆U (x)], where ∆U (x) = U1 (x) − U0 (x)
denotes the difference in the potential energy between the target and the reference states.

大家是怎么判斷FEP模擬是否收斂的？

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1樓 2011-09-26 16:17:18

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