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qianbh至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
結(jié)構(gòu)中的游離水,位于二重軸附近,旋轉(zhuǎn)后二個(gè)O原子相距離太近,不知如何處理?
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| 解一個(gè)配合物結(jié)構(gòu),碰到游離水的氧原子,GROW后二個(gè)氧原子1.3-1.4,不知如何處理。請(qǐng)高手指點(diǎn)! |
至尊木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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個(gè)人的見(jiàn)解。至少有3種辦法可以嘗試: (1)將該O位置的占有率設(shè)定為0.5或者以下,然后精修得到較為靠譜的占有率(小于等于0.5)。這樣的話,兩個(gè)O原子就不會(huì)打架了。因?yàn)檫@樣可以避免同時(shí)出現(xiàn)的情況; (2)如果對(duì)結(jié)構(gòu)的空間群不是很確定的話,可以考慮降低對(duì)稱性看看,比如說(shuō)去掉那個(gè)2次軸,再精修; (3)或者干脆先嘗試把那個(gè)水分子坐標(biāo)直接定在二次軸上,而不是二次軸附近?纯茨懿荒芫蕹龊侠淼慕Y(jié)構(gòu)出來(lái)。 |
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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