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qianbh至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
結(jié)構(gòu)中的游離水，位于二重軸附近，旋轉(zhuǎn)后二個O原子相距離太近，不知如何處理？
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| 解一個配合物結(jié)構(gòu)，碰到游離水的氧原子，GROW后二個氧原子1.3-1.4，不知如何處理。請高手指點(diǎn)！ |
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patriot_csu
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【答案】應(yīng)助回帖
qianbh(金幣+5): 謝謝您的指點(diǎn)，我先試試。 2011-10-03 20:39:49
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個人的見解。至少有3種辦法可以嘗試： （1）將該O位置的占有率設(shè)定為0.5或者以下，然后精修得到較為靠譜的占有率（小于等于0.5）。這樣的話，兩個O原子就不會打架了。因?yàn)檫@樣可以避免同時出現(xiàn)的情況； （2）如果對結(jié)構(gòu)的空間群不是很確定的話，可以考慮降低對稱性看看，比如說去掉那個2次軸，再精修； （3）或者干脆先嘗試把那個水分子坐標(biāo)直接定在二次軸上，而不是二次軸附近。看看能不能精修出合理的結(jié)構(gòu)出來。 |
2樓2011-10-03 17:30:34
knight1014
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3樓2011-10-03 17:35:41
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4樓2011-10-04 09:41:52
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