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wang06x木蟲 (小有名氣)
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[求助]
熱傳導(dǎo)邊界問題
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最近看論壇上一些熱傳導(dǎo)例子，幫助很大。首先感謝前輩們的無私奉獻(xiàn)精神。 同時(shí)我有些問題很困惑，希望大家給予解答。十分感激！ 1.我發(fā)現(xiàn)例子中3個(gè)方向都是周期性邊界條件，那么請(qǐng)問G-K公式、MP法 以及fix heat法這三種方法可以使用非周期邊界條件么?如 f p p 2.我自己嘗試了把條件改為f p p可是 出現(xiàn)了丟失原子(lost atoms)的情況，請(qǐng)問這是為什么？看相關(guān)帖子說可能是有覆蓋的原子，應(yīng)該用minimize 命令，可是我用了之后，雖然不像原來的那樣一開始就出現(xiàn)lost atoms ，但是跑了幾步之后仍然出現(xiàn)了。 3.還有的人說可以用fix wall/reflect 命令，我分別嘗試了命令:fix 1 all wall/refiect xlo -150 xhi 150 units box(盒子x方向尺寸是-100-100.單位是metal) 或者fix 2 all wall/reflect xlo EDGE xhi EDGE 。可是還是會(huì)出現(xiàn)lost atoms.是我的命令用錯(cuò)了么？ 4.論壇上例子中NEMD法貌似都是先給定熱流密度的，那么請(qǐng)問有沒有使用分子動(dòng)力學(xué)模擬給定溫度梯度的熱傳導(dǎo)方面相關(guān)理論文獻(xiàn)�。� 問題有點(diǎn)多。水平有限，真的想不出來。希望大家給予解答，十分感謝！ |
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brucefan
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第一，用自由邊界條件是可能丟失原子的，這就類似于初中學(xué)過的升華現(xiàn)象。所以，用nemd時(shí)最好用固定邊界條件，即固定兩端一小部分原子。用nemd方法時(shí)也可以用周期邊界條件，此時(shí)熱流會(huì)從熱源左右兩端流出，從熱匯左右兩端流入。即使用了這兩種邊界條件，系統(tǒng)在高溫下還是有可能不穩(wěn)定，因?yàn)檫@是非平衡模擬，就是不那么穩(wěn)定。第二，可以先用速度標(biāo)度法或動(dòng)量交換法產(chǎn)生熱流，再測(cè)量溫度梯度，也可以用熱浴，如郎之萬熱浴或者nose-hoover chain熱浴控制熱源和熱匯的溫度。它們都大同小異。第三，如果用emd方法，即格林-久保公式，在輸運(yùn)方向必須用周期邊界條件，在其它方向的邊界條件視模擬體系而定。以上所說都是熱導(dǎo)率模擬的最基本知識(shí)，文獻(xiàn)有幾百篇，其中重要的有幾十篇，樓主可自行查閱，不可看看lammps的例子就拉到。我看過lammps作者關(guān)于熱導(dǎo)率模擬的一個(gè)ppt，感覺他并不是很懂。 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
3樓2016-07-15 18:30:16
咫尺天涯1991
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2樓2016-07-15 09:51:20
brucefan
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第一，用自由邊界條件是可能丟失原子的，這就類似于初中學(xué)過的升華現(xiàn)象。所以，用nemd時(shí)最好用固定邊界條件，即固定兩端一小部分原子。用nemd方法時(shí)也可以用周期邊界條件，此時(shí)熱流會(huì)從熱源左右兩端流出，從熱匯左右兩端流入。即使用了這兩種邊界條件，系統(tǒng)在高溫下還是有可能不穩(wěn)定，因?yàn)檫@是非平衡模擬，就是不那么穩(wěn)定。第二，可以先用速度標(biāo)度法或動(dòng)量交換法產(chǎn)生熱流，再測(cè)量溫度梯度，也可以用熱浴，如郎之萬熱浴或者nose-hoover chain熱浴控制熱源和熱匯的溫度。它們都大同小異。第三，如果用emd方法，即格林-久保公式，在輸運(yùn)方向必須用周期邊界條件，在其它方向的邊界條件視模擬體系而定。以上所說都是熱導(dǎo)率模擬的最基本知識(shí)，文獻(xiàn)有幾百篇，其中重要的有幾十篇，樓主可自行查閱，不可看看lammps的例子就拉到。我看過lammps作者關(guān)于熱導(dǎo)率模擬的一個(gè)ppt，感覺他并不是很懂。 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
4樓2016-07-15 18:31:02
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