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xiajing_acm新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于Western的許多不明白與不清楚的地方
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給位大俠: 你們好! 我剛開始做western,試驗中碰到許多問題,勞駕幫我一下,非常感謝! 我做的蛋白包括p21(21KD)、CyclinD1(37KD)、HDAC3(49KD)、HDAC4(119KD)及內(nèi)參beta-actin(42KD)。 1、關(guān)于加樣及電泳:因為我做的大部分是核蛋白,所以提核蛋白做的。可核蛋白濃度每次提的都很低,最小的只有0.65ug/ul左右,1mm的梳子(最大上樣量44ul)最多大約只能加20ug,不知道上樣量是不是不夠呢?上樣的時候總有樣品溢出污染另一孔,對于上大體積的樣大家有好的加樣方法嗎?p21較小,電泳的時候跑到底20KD Marker都看不清楚,該如何判斷是否已經(jīng)跑開了呢? 2、關(guān)于轉(zhuǎn)膜:我用的濕轉(zhuǎn)0.45umPVDF膜,第一次用250mA轉(zhuǎn)2h,發(fā)現(xiàn)預(yù)染Marker已經(jīng)轉(zhuǎn)到濾紙上了,可曝光內(nèi)參條帶還比較清晰,p21沒有條帶;第二次用250mA轉(zhuǎn)1h,p21隱約有條帶,而250mA轉(zhuǎn)2h發(fā)現(xiàn)CyclinD1與HDAC3卻沒有條帶。請教下大家:預(yù)染Marker轉(zhuǎn)到濾紙上就證明蛋白轉(zhuǎn)過了嗎?我到底該如何選擇p21(21KD)、CyclinD1(37KD)、HDAC3(49KD)、HDAC4(119KD)及內(nèi)參beta-actin(42KD)的轉(zhuǎn)膜條件呢? 3、一抗孵育:這里要說一下,我的抗體p21與CyclinD1是Santa的,p21已經(jīng)過了1年零8個月的樣子,CyclinD1快到一年;HDAC3與HDAC4是CST的,超過送貨期1年8個月了,不知道做的效果不好是不是跟抗體過期有關(guān)?可是內(nèi)參時間也過了很久能做出來啊,這是怎么回事呢?是ProteinTech的!怎樣檢驗一抗是否過期及效價呢?還有,沒有熱熔機該如何孵育一抗呢?室溫還是4度過夜? 4、發(fā)光及顯影:發(fā)光液加到膜上一般發(fā)光多久曝光呢?尤其是看不到熒光的情況下?是不是等一段時間?我用的是Pierce的SuperSignal Substrate!有時候加發(fā)光液后整個膜發(fā)亮,但不見熒光條帶是怎么回事呢?還有,曝光的時間一般多少比較好? 問題太多,希望大家?guī)蛶兔Π!謝謝啦! |
蛋白質(zhì)生物學(xué)實驗經(jīng)驗 |
金蟲 (著名寫手)
金蟲 (小有名氣)
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1 不知道你是用什么方法提蛋白的,蛋白量低,可以通過擴大細(xì)胞培養(yǎng),多裂些細(xì)胞。上樣,盡量不用全部上滿,上樣速度快點,否則樣品會漂的。電泳時間當(dāng)然是看marker了,跑 p21這樣的小蛋白,膠配濃一些的,用12%的,以及 marker看不清楚是什么意思@@預(yù)染marker就是讓你看大小決定電泳什么時候停止的 2 轉(zhuǎn)膜時間是根據(jù)目標(biāo)蛋白的大小來看的,不可能一個條件所有大小蛋白質(zhì)都是最好條件,大分子量蛋白要轉(zhuǎn)時間長否則不充分,小分子量蛋白要轉(zhuǎn)短,否則容易轉(zhuǎn)過,這個還要結(jié)合上樣量和蛋白質(zhì)表達的量,marker轉(zhuǎn)到濾紙,內(nèi)參還有信號,是因為內(nèi)參本身表達量就高,留在膜里的部分就相當(dāng)多,自然能檢測到信號?梢韵仍囋100V轉(zhuǎn)1:30min,根據(jù)結(jié)果適當(dāng)調(diào)整,如果蛋白信號差距大,建議分開轉(zhuǎn)膜。 3 不同的抗體性質(zhì)不一樣,有些過期很多年都沒關(guān)系,可以先過量使用一抗體,看看有沒有信號。正常的孵育時間室溫1h, 或者4度過夜都可以,4度過夜效果好些。 4 發(fā)光液孵育時間看說明書,曝光時間是根據(jù)信號強弱調(diào)整的 |
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關(guān)于轉(zhuǎn)膜:內(nèi)參條帶還比較清晰,p21沒有條帶,內(nèi)參大于P21可能,p21轉(zhuǎn)過了;p21隱約有條帶,而250mA轉(zhuǎn)2h發(fā)現(xiàn)CyclinD1與HDAC3卻沒有條帶,因該是轉(zhuǎn)的時間不到。具體條件你得摸下 一抗,4度過夜較好,先濃一點做出條帶來再優(yōu)化。特異性好不好,你得檢測下,最好使用文獻報道的或其他實驗室做了沒問題的抗體,否則不太好做出來。至于過期應(yīng)該不是太大的問題,只要不是過期很久就可以,多加些就是了。 |

銀蟲 (初入文壇)
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1.一般電泳儀應(yīng)該配套1.5mm的梳子吧,20μg的蛋白量可以吧,我做的上30μg的上樣量曝光時間很短的,還有樓主的上樣槍頭是不是那種很長的,那種的好用些。我做過分力量為23左右的蛋白,用的是12%的膠,maker可以適當(dāng)加量吧,應(yīng)該挺清楚地。 2.我轉(zhuǎn)膜時用的是106v的恒壓,問題不大(目的蛋白最低23,最高95)不知是不是用于你的實驗。 3.我導(dǎo)師從外面回來時帶回來的一抗,估計不太到一年,就沒有什么效果了,你的一抗是不是也不太好了?當(dāng)然也可能是跟你膜上的目的蛋白豐度不太大有關(guān),你用麗春紅染液染染看看,在相應(yīng)位置是否用條帶。封口機很便宜的也不用太好,這樣關(guān)鍵是節(jié)省抗體,以前沒有的時候我們用個小方盒,包上保鮮膜,4℃過夜,那樣抗體蒸發(fā)很厲害,你可以在保鮮膜上壓下一個小錐形,讓蒸發(fā)的液體都集中在錐形頂端,方便回收。 4.加入發(fā)光試劑后可適當(dāng)?shù)鹊,關(guān)上燈看看,要是看不到很可能就沒有蛋白,要是全膜都發(fā)亮要不就是你的一抗特異性不強,要不就是封閉有問題,曝光時間你自己可以摸索一下,膜是可以重復(fù)曝光的,如果熒光消失了,可用TBST清洗一下,再加上發(fā)光試劑就可以再用了。 我也剛開始做,有些不一定對,希望哪點可以幫到你 |
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