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賀儀鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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GAUSSIAN怎么計(jì)算overlap matrix？
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本人非專(zhuān)業(yè)GAUSSIAN使用者，請(qǐng)問(wèn)GAUSSIAN怎么計(jì)算overlap matrix ， molecular orbital coefficients and energies ？如果可以，請(qǐng)列出輸入文件，謝謝！ F0= SCC ,沒(méi)法顯示…… where S is the intermolecular overlap matrix, and C and are the dimer Kohn-Sham orbital’s coefficients and energies. The noninteracting molecular orbitals of the two individual molecules are calculated separately by the standard self- consistent field procedure. These noninteracting orbitals are then used to construct the dimer Kohn-Fock matrix. Namely, it takes directly the unperturbed individual molecule’s orbital and density matrix to guarantee that originally, the two mol- ecules are noninteracting, and only when putting them to- gether, one can get interaction information with respect to the individual molecules in the spirit of first-order perturba- tion. All of the calculations are performed with the GAUSSIAN 03 package 詳細(xì)的請(qǐng)看PHYSICAL REVIEW B 79, 115203 2009 [ Last edited by 賀儀 on 2011-10-17 at 16:20 ] |
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beefly
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2樓2011-10-17 11:26:14
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
ben_ladeng(金幣+2): 謝謝斑竹 2011-10-17 11:49:06
賀儀(金幣+5): 謝謝，還是有點(diǎn)問(wèn)題…… 2011-10-17 14:46:24
ben_ladeng(金幣+2): 謝謝斑竹 2011-10-17 11:49:06
賀儀(金幣+5): 謝謝，還是有點(diǎn)問(wèn)題…… 2011-10-17 14:46:24
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既是非專(zhuān)業(yè)GAUSSIAN使用者，你是問(wèn)如何在輸出結(jié)果中得到相應(yīng)的數(shù)據(jù)吧。 加關(guān)鍵詞：Pop=Full，得到：molecular orbital coefficients and energies 加關(guān)鍵詞：iop(3/33=1)，得到：overlap matrix |
3樓2011-10-17 11:26:44
beefly
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ben_ladeng: 專(zhuān)家考核存檔 2011-10-17 11:49:17
zhou2009(金幣+2): 2011-10-17 12:43:57
賀儀(金幣+5): 謝謝，還是有點(diǎn)問(wèn)題…… 2011-10-17 14:46:15
ben_ladeng: 專(zhuān)家考核存檔 2011-10-17 11:49:17
zhou2009(金幣+2): 2011-10-17 12:43:57
賀儀(金幣+5): 謝謝，還是有點(diǎn)問(wèn)題…… 2011-10-17 14:46:15
| 如果你問(wèn)“怎么計(jì)算overlap matrix”：gaussian至少有兩種算法。iop(3/38=2)用標(biāo)準(zhǔn)公式算。目前默認(rèn)的prism方法很繁瑣，思路是先把所有積分轉(zhuǎn)化成標(biāo)準(zhǔn)的雙電子積分一般公式，然后用統(tǒng)一的方法計(jì)算，有點(diǎn)畫(huà)蛇添足的感覺(jué)。 |
4樓2011-10-17 11:31:29
賀儀
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5樓2011-10-17 14:45:48
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【答案】應(yīng)助回帖
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為什么只是算兩個(gè)分子HOMO之間的呢？而且還只是overlap integral呢？ 兩個(gè)分子之間的作用并不是二者HOMO之間的作用，把兩個(gè)分子放在一起算，之間的作用就都有了。 當(dāng)然如何放分子，可以觀察A的HOMO與B的LUMO，或者A的LUMO與B的HOMO，看二者如何搭配、放置作為初始優(yōu)化的起點(diǎn)比較好。優(yōu)化的結(jié)果就得到了兩個(gè)分子之間的作用了。 兩個(gè)分子之間的overlap integral，只是軌道（用基組表達(dá)的）之間的，說(shuō)明不了問(wèn)題。要考察的是重疊布居。 將AB的計(jì)結(jié)果在Multiwfn中求全AB的電子密度ρAB，并在Multiwfn中進(jìn)一步分別求分子片A、分子片B的電子密度ρa(bǔ)、ρB。求電子密度差Δρ=ρAB-ρa(bǔ)-ρB。 這時(shí)Δρ就是分子片A、分子片B之間的重疊布居。 [ Last edited by zhou2009 on 2011-10-17 at 19:30 ] |
9樓2011-10-17 17:38:02
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