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leewz922金蟲 (小有名氣)
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[求助]
求解SHAKE 算法的具體過(guò)程，公式或代碼？
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| 請(qǐng)教大家，SHAKE 對(duì)健長(zhǎng)和健角的約束是如何實(shí)現(xiàn)的，請(qǐng)教具體的公式，算法，或者告訴我那本書有具體的教程？謝謝 |
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winterz
木蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-10-21 18:45:47
ghcacj(金幣+3): 謝謝 2011-10-21 18:45:47
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SHAKE的原始文獻(xiàn)： J. Ryckaert, G. Ciccotti, H. J. C. Berendsen "Numerical integration of the cartesian equations of motion of a system with constraints: molecular dynamics of n-alkanes", Journal of Computational Physics, 1977, 23, pp.327-341 你可以找來(lái)看一下。另外，很多MD軟件的手冊(cè)上都有SHAKE的描述，如GMX、DL_POLY等。 |
2樓2011-10-20 16:55:36
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