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wolveshunter至尊木蟲 (著名寫手)
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[求助]
求DS2.5里PBSA的CHARMmpbsa.xml文件
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RT~~ 誰有這個(gè)文件，上網(wǎng)也搜不到~~ |
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qixingbao07
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
御劍江湖(金幣+5, 模擬EPI+1): 謝謝 2011-10-23 10:25:10
御劍江湖(金幣+5, 模擬EPI+1): 謝謝 2011-10-23 10:25:10
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轉(zhuǎn)載 解決DS中加載CHARMmMMPBSA.xml的問題 版本為2.5才行 你搜索一下Scitegic目錄下的pbsa應(yīng)該就可以找到，原來的文件名應(yīng)該是CHARMmMMPBSA.xml 1.用記事本打開CHARMmMMPBSA.xml 2.查找 "" 3.第一個(gè)匹配的 修改它下一行 就是這樣 應(yīng)該清楚了吧 如： Ls是指DS里面算MM-PBSA嗎？先將受體單獨(dú)保存為pdb文件，將配體單獨(dú)保存為mol2文件，在Input Receptor File和Input Ligands File里面分別選中這兩個(gè)文件，點(diǎn)Run就可以了。 你搜索一下Scitegic目錄下的pbsa應(yīng)該就可以找到，原來的文件名應(yīng)該是CHARMmMMPBSA.xml 修改它下一行 就是這樣 應(yīng)該清楚了吧 |
2樓2011-10-22 06:19:09
qixingbao07
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wolveshunter(金幣+20): 謝謝，雖然寫的有點(diǎn)亂，好歹我還是找到了 2011-10-22 13:15:01
ghcacj(金幣+10): 謝謝 2011-10-23 14:51:49
wolveshunter(金幣+20): 謝謝，雖然寫的有點(diǎn)亂，好歹我還是找到了 2011-10-22 13:15:01
ghcacj(金幣+10): 謝謝 2011-10-23 14:51:49
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第一次不全 解決DS中加載CHARMmMMPBSA.xml的問題 版本為2.5才行 以前給大家提供了一個(gè)通過PP來將MM-PBSA導(dǎo)入到DS中的方法，現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)了一個(gè)更為簡(jiǎn)便的方法，不需要再安裝PP了。 1.用記事本打開 Binding Energy with MM-PBSA.xml 2.查找 "The user who registered this component" 3.第一個(gè)匹配的 4.修改它下一行 修改它下一行 就是這樣 應(yīng)該清楚了吧 如： Ls是指DS里面算MM-PBSA嗎？先將受體單獨(dú)保存為pdb文件，將配體單獨(dú)保存為mol2文件，在Input Receptor File和Input Ligands File里面分別選中這兩個(gè)文件，點(diǎn)Run就可以了。 你搜索一下Scitegic目錄下的pbsa應(yīng)該就可以找到，原來的文件名應(yīng)該是CHARMmMMPBSA.xml 修改它下一行 就是這樣 應(yīng)該清楚了吧 |
3樓2011-10-22 06:21:31
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