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電泳篩選SSR引物時(shí)，只跑出了一條帶，這樣正常嗎？是不是說(shuō)明SSR引物沒(méi)有多態(tài)性？
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6對(duì)引物，分別對(duì)4個(gè)個(gè)體（來(lái)自不同的群體）基因組DNA進(jìn)行PCR和電泳，結(jié)果每對(duì)引物都跑出了一樣大小的帶（在4個(gè)模板中），有誰(shuí)做過(guò)SSR引物開(kāi)發(fā)方面的，歡迎賜教，結(jié)果見(jiàn)圖。 注：除引物4沒(méi)有跑出條帶，引物3產(chǎn)物偏大外，其他4對(duì)引物的產(chǎn)物大小和預(yù)期的基本一樣。 |
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2樓2011-10-25 07:06:11
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3樓2011-10-25 07:55:03
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我最近在做SSR引物開(kāi)發(fā)方面的實(shí)驗(yàn)，那位對(duì)這方面比較了解，以后可以加強(qiáng)交流啊。準(zhǔn)備用Popgen對(duì)電泳圖進(jìn)行分析，但現(xiàn)在對(duì)電泳條帶如何統(tǒng)計(jì)還不是很清楚？那位比較了解。 1.進(jìn)行SSR標(biāo)記時(shí)，每個(gè)個(gè)體的PCR產(chǎn)物電泳，理論上只能產(chǎn)生一條帶或兩條帶嗎？（當(dāng)然也可能沒(méi)有條帶） 2.用popgen進(jìn)行分析的時(shí)候，群體材料一定是用AA,BB,AB,AC等形式來(lái)統(tǒng)計(jì)條帶嗎？進(jìn)行多物種親緣關(guān)系的分析時(shí)，是不是要使用0,1矩陣來(lái)統(tǒng)計(jì)條帶？ |
4樓2011-10-25 15:10:01
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