 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 8869 | 回復(fù): 23 | |||||||||||||||||
| 本帖產(chǎn)生 2 個(gè) 模擬EPI ，點(diǎn)擊這里進(jìn)行查看 | |||||||||||||||||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||||||||||||||||
[交流]
關(guān)于勢函數(shù)的求助
|
|||||||||||||||||
|
相信做分子模擬親們都會用到勢函數(shù)？ 但是請問大家的勢函數(shù)參數(shù)如何取得的呢？ 我也相信有部分童鞋是查得文獻(xiàn)，同時(shí)肯定也有部分童鞋是自己擬合的。 請問是通過什么方法或軟件擬合呢？希望有詳細(xì)的步驟和例子。 感謝大家！感謝蟲子們！ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 資源收集 | 分子動力學(xué) | 分子模擬 | 模擬知識匯總 |
| MS 吸附模擬 | 模型 - 模擬 - 統(tǒng)計(jì) - 熱力學(xué) | 我學(xué)習(xí)計(jì)算的一些帖子 | 動力學(xué)模擬 |
| 模擬軟件安裝精華淘 | 動力學(xué)強(qiáng)帖 | 我的分享 | MS學(xué)習(xí) |
| 力場 | 分子動力學(xué) |
» 猜你喜歡
288求調(diào)劑 一志愿哈工大 材料與化工
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
化學(xué)工程085602 305分求調(diào)劑
已經(jīng)有31人回復(fù)
-
070300化學(xué)專業(yè)279調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
085404 22408 315分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿a區(qū)211，085601-307分求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
290分調(diào)劑求助
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿華東理工大學(xué)，080500學(xué)碩，317分，求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
考研調(diào)劑求助
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 關(guān)于吸附MD方面，跪求指導(dǎo)。
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 關(guān)于周期信號的收斂性的問題
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 空位遷移能的計(jì)算
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 請教吸附動力學(xué)擬合
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 勢函數(shù)截?cái)嗑嚯x如何�。�
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 請問勢函數(shù)在lammps官網(wǎng)中怎么下載？
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 分子動力學(xué)勢函數(shù)
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 離子遷移數(shù)的測定
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 擬和Cu-Al勢函數(shù)
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 【求助】量子化學(xué)方法求amber力場參數(shù)
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助】求 嵌入勢函數(shù) 的物理解釋
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】ms中如何假如勢函數(shù)，比如EAM，比如自己修改過的勢函數(shù)。
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】塑性與彈性勢函數(shù)
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于ISIF的選擇
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助】MS建模導(dǎo)入lammps問題求救
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】LAMMPS中非周期性邊界條件和Born-Mayer-Huggins勢函數(shù)不會設(shè)置
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 搶金幣啦！回帖就可以得到:
-
2026級藥學(xué)學(xué)碩調(diào)劑招生
+1/287
-
【招聘】溫州醫(yī)科大學(xué)/附屬醫(yī)院/甌江實(shí)驗(yàn)室李校堃院士團(tuán)隊(duì)誠聘博士后和科研人員
+1/184
-
湖北大學(xué)陳苗苗教授食品安全研究團(tuán)隊(duì)誠招博士生
+1/178
-
留學(xué)--博士招生
+1/50
-
新疆碳納米材料制備與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2026年招聘啟事
+1/39
-
中原食品實(shí)驗(yàn)室 & 鄭州輕工業(yè)大學(xué)2026年碩士研究生聯(lián)合培養(yǎng)調(diào)劑公告
+1/37
-
北京理工大學(xué)-化學(xué)與化工學(xué)院-招收2026級博士生 [申請-考核制]
+1/23
-
中國地震局地質(zhì)研究所+地球物理/數(shù)學(xué)+接收調(diào)劑
+1/16
-
西安工程大學(xué)能源化工新材料研發(fā)項(xiàng)目組接收2026年計(jì)算機(jī)類調(diào)劑研究生
+1/10
-
食品學(xué)碩考研調(diào)劑
+1/10
-
歡迎加入我們的團(tuán)隊(duì)！招博士 半導(dǎo)體光電子器件與集成
+1/10
-
西工大海洋研究院招收26年博士后1名
+1/10
-
哈工程煙臺院材化專業(yè)調(diào)劑信息
+1/10
-
南昌航空大學(xué) 材料學(xué)院 招材料類調(diào)劑研究生，名額多，上岸機(jī)會大
+1/9
-
重慶工商大學(xué) 教育部研究中心招收化工/環(huán)境/材料/石油/機(jī)械方向2026年調(diào)劑研究生
+1/9
-
歡迎調(diào)劑報(bào)考
+1/6
-
湖北師范大學(xué)招調(diào)劑啦
+1/6
-
青島大學(xué)紡織服裝學(xué)院 極端環(huán)境紡織材料與制品團(tuán)隊(duì)碩士招生
+1/3
-
2026年江西科技師范大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院隋曉鋒課題組招收碩士研究生調(diào)劑
+1/3
-
0854工學(xué)-電子信息考研-302分求調(diào)劑，接受跨專業(yè)，只求有學(xué)上！�。� ! ! ! ！
+1/2
|
非常感謝你的回答，說實(shí)話，我沒有完全聽懂你的意思，我是搞材料的，對計(jì)算化學(xué)、計(jì)算物理懂一點(diǎn)點(diǎn)，皮毛，嘿嘿。 我先介紹一下目前我的情況吧。我做的材料屬于離子氧化物，用的勢函數(shù)形式是buckingham和shel（暫時(shí)不討論），但目前我最關(guān)心的是buckingham這個(gè)二體勢，我想擬合這個(gè)勢的參數(shù)。我從文獻(xiàn)中已經(jīng)找到了一些勢參數(shù)，但是我在驗(yàn)證的這些參數(shù)的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)得到的晶格常數(shù)與實(shí)驗(yàn)值相差4%，對這些通過文獻(xiàn)得到的參數(shù)有點(diǎn)不滿，所以我就想自己去擬合這些參數(shù)，請問該如何辦呢？材料體系的離子是Bi、Zn、Nb、O。 |
3樓2011-10-26 15:17:52
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
御劍江湖(金幣+10, 模擬EPI+1): 謝謝 2011-10-27 17:16:14
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖
御劍江湖(金幣+10, 模擬EPI+1): 謝謝 2011-10-27 17:16:14
|
MS中的Gulp模塊適合你。 看看手冊吧。我也沒用過。 晶體結(jié)構(gòu)(a,b,c)4%的誤差是稍微有點(diǎn)大。擬合力場晶體結(jié)構(gòu)方面的偏差一般能達(dá)到2%以內(nèi)，密度方面小于5%, 晶格能方面小于10%。因?yàn)楸仨毧紤]實(shí)驗(yàn)值也是有誤差的。晶格能，蒸發(fā)焓這些實(shí)驗(yàn)值的誤差也在10%左右，刻意弄成跟實(shí)驗(yàn)值完全一致沒有必要，只要跟類似的物質(zhì)比，結(jié)合能定性大小順序符合即可； 另外，你還要問自己，即你要研究的問題是什么？這個(gè)問題需要多精確的晶格常數(shù)值？因?yàn)橛袝r(shí)候你調(diào)了參數(shù)，看上去與實(shí)驗(yàn)值更接近了，可是一跑動力學(xué)，一升高溫度，得到的結(jié)果反而更差。比如你現(xiàn)在要預(yù)測體積膨脹系數(shù)，那我建議你先用現(xiàn)在的參數(shù)跑一些模擬，得到一些結(jié)果，看看跟實(shí)驗(yàn)值的誤差有多大。如果在5%以內(nèi)是能夠接受的。 初學(xué)者往往會產(chǎn)生錯(cuò)覺，以為分子模擬能真實(shí)再現(xiàn)所有原子過程并給出精確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。但其實(shí)經(jīng)典力場本身是個(gè)十分粗糙的模型，它忽略了電子的運(yùn)動，把原子看成是帶電荷的球，分子間的作用通過一個(gè)簡化的數(shù)學(xué)模型（Buckingham+coulomb）來表達(dá)，沒有多體作用(可達(dá)~5%)，沒有極化(可達(dá)1%)，請問你覺得這在多大程度上符合真實(shí)的原子結(jié)構(gòu)和相互作用？一般來說， 我們使用分子力學(xué)模型并非是為了完全精確預(yù)測實(shí)驗(yàn)結(jié)果，而是來定性地研究某一性質(zhì)的變化規(guī)律，或者現(xiàn)象背后的原子過程。即，關(guān)注相對值，而非絕對值。 我并不是不建議你調(diào)參數(shù)，相反我認(rèn)為做模擬的都要嘗試驗(yàn)證參數(shù)，可能的話通過擬合更多的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來改進(jìn)參數(shù)。但是在調(diào)參數(shù)的時(shí)候，要認(rèn)識到力場模型的局限性，以及它的誤差范圍和精度范圍。想像你拿的是一把最小刻度為cm的尺子，而兩根棍子的長度差別是幾個(gè)mm。你能得到精確的結(jié)果嗎? [ Last edited by ChemiAndy on 2011-10-26 at 11:32 ] |
4樓2011-10-26 23:52:22
|
你好！你的回答讓我茅塞頓開，非常感謝！ 我研究的是材料的缺陷，是化學(xué)缺陷，不是物理缺陷，舉個(gè)例子吧：1、研究晶體中某個(gè)原子的取代，某個(gè)原子的空缺，某個(gè)原子離開自己的位置跑到間隙去了等等一系列的問題，然后計(jì)算這個(gè)過程產(chǎn)生的能量，再舉個(gè)例子吧：2、當(dāng)我向這個(gè)材料體系中去摻雜的時(shí)候，我要摻雜的離子（非常微量、基本不影響原材料體系的晶體結(jié)構(gòu)）可能會占據(jù)原體系材料的那個(gè)位置，通過模擬計(jì)算得出能量值，然后就可以判斷雜質(zhì)離子可能會進(jìn)入哪個(gè)位置，然后來指導(dǎo)我的實(shí)驗(yàn)。 在這種情況下，我在選取勢參數(shù)（原材料體系的）的時(shí)候，驗(yàn)證參數(shù)的合理性，應(yīng)該考慮它的哪些因素？比如晶格常數(shù)、彈性模量、密度、結(jié)合能等等，你覺得哪個(gè)最重要，其實(shí)我也知道研究不同的內(nèi)容，要求的不一樣。也就是說選取的勢參數(shù)不可能同時(shí)保證晶格常數(shù)、彈性模量、密度、結(jié)合能都和實(shí)驗(yàn)值想符合，在這種情況下，你覺得我在判斷勢參數(shù)合理性時(shí)，最應(yīng)該關(guān)注哪一個(gè)參考量呢？目前我只考慮了晶格常數(shù)這一個(gè)參考量。 |
5樓2011-10-27 09:53:02
7樓2011-10-27 20:55:26
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑 +7 | 11ggg 2026-03-30 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿中國科學(xué)院大學(xué)265求調(diào)劑 +6 | 恬淡ye 2026-03-31 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +6 | BrightLL 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑求院校招收 +7 | 鶴鯨鴿 2026-03-28 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +4 | 研s. 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研生物與醫(yī)藥調(diào)劑 +3 | 鐵憨憨123425 2026-03-31 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 317求調(diào)劑 +8 | 十閑wx 2026-03-24 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 求收留 +6 | 1943443204 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑 +8 | 嗯滴的基本都 2026-03-27 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 環(huán)境科學(xué)與工程334分求調(diào)劑 +6 | 王一一依依 2026-03-30 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +8 | 楒桉 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 086000生物與醫(yī)藥調(diào)劑 +5 | Feisty。 2026-03-28 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +13 | zhn03 2026-03-25 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 調(diào)劑 +3 | 好好讀書。 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料277求調(diào)劑 +7 | min3 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 086502化學(xué)工程342求調(diào)劑 +6 | 阿姨復(fù)古不過 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)求調(diào)劑，各位老師看看我！�。� +5 | 祁祺祺 2026-03-25 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 272求調(diào)劑 +7 | 腳滑的守法公民 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考博] 26申博 +3 | 加油沖�。� 2026-03-26 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0854人工智能方向招收調(diào)劑 +4 | 章小魚567 2026-03-24 | 4/200 |
|