 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 10269 | 回復(fù): 12 | |||||
[交流]
請問高通量測序中深度和覆蓋度是什么意思？ 已有11人參與
|
|||||
| 大家好，請問高通量測序中深度（depth）以及覆蓋度（coverage）是什么意思，二者有什么區(qū)別？ |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 生物科學(xué)系列 | 高通量測序 |
» 猜你喜歡
085801 總分275 本科新能源 求調(diào)劑
已經(jīng)有22人回復(fù)
-
298分 070300求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料與化工306分找調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
070305高分子化學(xué)與物理 304分求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
260求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
299求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求調(diào)劑求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
265求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
070300化學(xué)求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
296材料專碩求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對您同樣有幫助:
- potential vs. Li+/Li 到底是什么意思啊
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 求助 高通量測序
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 1/5KMnO4=0.1 mol/L 前面的分?jǐn)?shù)表示的是質(zhì)量比 還是其他什么意思
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 聚丙烯的阻燃劑分解溫度應(yīng)該是多少？
已經(jīng)有13人回復(fù)
- 測血藥濃度，加入內(nèi)標(biāo)的體積多大為好？濃度如何選定？
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 怎樣測量河水深度和河底淤泥厚度？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- PCR后測序，blast最高匹配度只有32%
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 請問目前國內(nèi)有哪些可以做高通量測序的公司？
已經(jīng)有26人回復(fù)
- 牛人幫我看一下，編輯這是什么意思
已經(jīng)有3人回復(fù)
holyala
木蟲 (著名寫手)
磚家
- BioEPI: 1
- 應(yīng)助: 19 (小學(xué)生)
- 貴賓: 0.001
- 金幣: 1137.7
- 散金: 322
- 紅花: 20
- 帖子: 1866
- 在線: 267.8小時(shí)
- 蟲號: 457557
- 注冊: 2007-11-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 基因組學(xué)
★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
adslye(金幣+2): 鼓勵交流，祝順利！ 2011-11-01 09:48:21
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖
adslye(金幣+2): 鼓勵交流，祝順利！ 2011-11-01 09:48:21
|
depth嘛，就是被測基因組上單個堿基被測序的平均次數(shù)，比如某樣本的測序深度為30X，那么就是說該樣本的基因組上每一個單堿基平均被測序（或者說讀�。┝�30次，注意，是平均。當(dāng)然了，depth也有最大和最小值，這個都可以由信息分析得到。 coverage就好理解了，由于大片段拼接的gap、測序讀長有限、重復(fù)序列等問題的存在，測序分析后組裝得到的基因組序列通常無法完全覆蓋所有區(qū)域，覆蓋度就是最終得到的結(jié)果占整個基因組的比例。例如一個人的基因組測序，覆蓋度為98.5%，那么說明該基因組還有1.5%的區(qū)域通過我們的組裝和分析無法得到。 至于什么算法之類的，太深了，應(yīng)該不用了解吧~~偶也寫不出來。。。  當(dāng)然，轉(zhuǎn)錄組也同上。 [ Last edited by holyala on 2011-10-31 at 21:51 ] |
3樓2011-10-31 21:49:24
gaoyang636
木蟲 (著名寫手)
- BioEPI: 17
- 應(yīng)助: 202 (大學(xué)生)
- 金幣: 4111.4
- 散金: 7
- 紅花: 14
- 帖子: 1108
- 在線: 159.8小時(shí)
- 蟲號: 384065
- 注冊: 2007-05-27
- 專業(yè): 基因組學(xué)
2樓2011-10-31 08:40:26
adslye
銀蟲 (正式寫手)
- BioEPI: 10
- 應(yīng)助: 6 (幼兒園)
- 貴賓: 0.244
- 金幣: 364.9
- 散金: 766
- 紅花: 6
- 帖子: 514
- 在線: 119.5小時(shí)
- 蟲號: 845336
- 注冊: 2009-09-11
- 性別: GG
- 專業(yè): 流行病學(xué)方法與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)
4樓2011-11-01 09:47:23
5樓2011-11-01 16:42:47
6樓2012-01-04 15:33:26
7樓2012-02-16 10:13:52
sxj61506
金蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1534.8
- 散金: 3
- 帖子: 19
- 在線: 153.4小時(shí)
- 蟲號: 1173917
- 注冊: 2010-12-20
- 專業(yè): 植物進(jìn)化生物學(xué)
8樓2012-02-16 13:16:34
 |
9樓2012-02-16 16:51:03
 |
10樓2012-07-04 14:10:38
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 永不后悔2838 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 調(diào)劑求助 +4 | 想換手機(jī)不想解?/a> 2026-04-02 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +3 | 小小墨123 2026-04-02 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿北京科技大學(xué)085601材料工程英一數(shù)二初試總分335求調(diào)劑 +8 | 雙馬尾痞老板2 2026-04-02 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 309求調(diào)劑 +8 | 呆菇不是戴夫 2026-04-02 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +4 | 學(xué)員97LZgn 2026-04-02 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 能源動力 調(diào)劑 +3 | 不破不立0 2026-04-02 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600，材料與化工321分，求調(diào)劑 +13 | 大饞小子 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +9 | Gs大王 2026-04-02 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 322求調(diào)劑 +5 | 熹僖XX 2026-03-31 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 279求調(diào)劑 +6 | 學(xué)而思兮知 2026-04-01 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑一志愿北航070300，本科鄭大化學(xué) +8 | 圣日耳曼條 2026-04-01 | 11/550 |
|
|
|
[考博] 26年申博 +3 | staryer 2026-03-30 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085601材料工程找調(diào)劑 +20 | oatmealR 2026-03-29 | 21/1050 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +5 | lim0922 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 318一志愿吉林大學(xué)生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑 +6 | 篤行致遠(yuǎn). 2026-03-28 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿北林食品與營養(yǎng)095500，301分，已過六級，有科研經(jīng)歷 +4 | 快樂儲蓄罐 2026-03-31 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0856調(diào)劑 +7 | 曲聽筠 2026-03-30 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +3 | Acesczlo 2026-03-29 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 藥學(xué)105500求調(diào)劑 +3 | Ssun。。 2026-03-28 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 292求調(diào)劑 +4 | 求求了收下我吧?/a> 2026-03-26 | 4/200 |
|