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liuxing1-1至尊木蟲(chóng) (知名作家)
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[求助]
做DGGE的土壤樣品保存問(wèn)題
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RT 100bb求助啊。本人要做DGGE，但是土壤樣品已經(jīng)在-20度保存了將近半年時(shí)間，而且土樣因?yàn)楹康停](méi)有被凍住，想問(wèn)問(wèn)在這種情況下，能做DGGE嗎 |
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老夏853
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【答案】應(yīng)助回帖
liuxing1-1(金幣+5): 2011-11-09 09:13:27
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額 同行 土壤微生物群落多樣性用DGGE 來(lái)做 我目前也是這樣 不過(guò)我在思考一個(gè)問(wèn)題。DGGE 的分辨能力 有那么高么？？ 我做過(guò)最多的是 在一個(gè)泳道出現(xiàn)30幾條帶 但是用腳趾頭都能想到土壤里面的微生物群落 肯定不止這么點(diǎn) 就算是土壤在凍了很久之后也不至于只剩這么點(diǎn)存活 所以 DGGE 的分辨能力 很低 用來(lái)做小環(huán)境的微生物數(shù)量有限的樣品的時(shí)候 很有優(yōu)勢(shì) 要是做土壤 我去 ，真TMD 不靠譜 悲催的 可惜我一開(kāi)始就選錯(cuò)了 路 建議 去做高通量測(cè)序。每個(gè)樣品平均測(cè)個(gè)1000-2000 條 是目前較為理想的多樣性研究方法。 |
9樓2011-11-09 08:59:10
liuxing1-1
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2樓2011-11-03 08:18:42
ranerris
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7樓2011-11-03 16:29:05
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