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有關(guān)MS 的建模 優(yōu)化及計(jì)算的一些問(wèn)題
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最近在自學(xué)MS，也一直在論壇里逛，但對(duì)MS還是了解皮毛�，F(xiàn)在遇到一些問(wèn)題，希望各位MS高手能幫忙解答。 1， 如果我要構(gòu)建帶電的基團(tuán)，如硫酸根，該怎么構(gòu)建？ 請(qǐng)給出能夠看懂并進(jìn)行操作的步驟（現(xiàn)在掌握了構(gòu)建晶體， 團(tuán)簇， 表面，超胞，多層結(jié)構(gòu)） 2，在用CASTEP進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化時(shí)，Energy 圖如圖1所示，一直在振蕩，這個(gè)時(shí)候該設(shè)置哪些參數(shù)？怎么設(shè)置參數(shù)？（看網(wǎng)上的帖子，有設(shè)SCF, K-point。 我模擬的是過(guò)渡金屬Ni，及主族金屬Sn，金屬氧化物，對(duì)這些體系我該如何設(shè)置參數(shù)？） 圖1：優(yōu)化結(jié)構(gòu)時(shí)振蕩的Energy 圖 |
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2樓2011-11-06 13:23:43
青菜001
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3樓2011-11-06 19:34:32
青菜001
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
caijj09(金幣+5): 非常感謝！ 2011-11-07 18:15:20
zh1987hs(金幣+2): 謝謝 2011-11-07 19:25:01
zh1987hs(金幣+2): 謝謝 2011-11-07 19:25:03
zh1987hs(金幣+2): 謝謝 2011-11-07 19:25:22
caijj09(金幣+5): 非常感謝！ 2011-11-07 18:15:20
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zh1987hs(金幣+2): 謝謝 2011-11-07 19:25:22
| 我沒(méi)用過(guò)這么復(fù)雜的像硫酸根離子這樣的，但是我用過(guò)像氯離子的，沒(méi)有優(yōu)化，我覺(jué)得應(yīng)該是帶上電荷后再進(jìn)行正常順序的優(yōu)化（這僅代表我個(gè)人觀點(diǎn)，不一定對(duì)） |
4樓2011-11-07 15:43:33
5樓2011-12-16 17:52:10
流星雨
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chaizhm(金幣+4): 謝謝~ 2011-12-19 11:23:13
chaizhm(金幣+4): 謝謝~ 2011-12-19 11:23:13
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參數(shù)的設(shè)置不同體系、不同模型，都不一樣，建議你參看和你研究的類(lèi)似的文獻(xiàn)中的參數(shù)設(shè)置。 團(tuán)簇模型的構(gòu)建與周期性超胞模型前面都一樣，只是在build-supercell之后，如果要做周期性計(jì)算，則應(yīng)選擇build>Crystals>build vaccum slab，其中真空層通常選擇10埃以上。如果建立團(tuán)簇模型則選擇build>Symmetry>Non-periodic Structure，去掉模型的周期性，并跟據(jù)自己的實(shí)際需要?jiǎng)h除部分原子，得到想要的團(tuán)簇模型。 |
6樓2011-12-18 22:40:18
匿名 
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7樓2018-01-27 14:11:21
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