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lbh_xt新蟲 (小有名氣)
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[求助]
邊界條件、溫度、幾何優(yōu)化的問題求助
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求高手幫助： （1）MS建模分子動(dòng)力學(xué)模擬，如果我想模擬的整個(gè)體系的邊界是周期性的（xyz均為周期性的），該怎么設(shè)置呢？我想設(shè)置初始溫度為300K，該怎么設(shè)置呢？ 這些設(shè)置是在castep中進(jìn)行設(shè)置？還是在剛開始bulid 體系的時(shí)候就要進(jìn)行設(shè)置呢？ （3）如果在加有溫度的情況下，想分時(shí)間分系綜對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行模擬以求穩(wěn)態(tài)，該怎么辦。 （2）剛開始進(jìn)行幾何優(yōu)化的時(shí)候，我看好多都是build a primitive cell來進(jìn)行優(yōu)化的，可是如果是進(jìn)行體內(nèi)的隨機(jī)摻雜的話，是不是應(yīng)該對(duì)整個(gè)體系進(jìn)行優(yōu)化呢？ |
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御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-11-10 21:14:37
lbh_xt(金幣+5): 謝謝哈，明白了，我還想問一下，這個(gè)優(yōu)化體系的話，3X3X40UC的體系能算嗎？會(huì)不會(huì)很慢？ 2011-11-12 16:35:10
御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-11-10 21:14:37
lbh_xt(金幣+5): 謝謝哈，明白了，我還想問一下，這個(gè)優(yōu)化體系的話，3X3X40UC的體系能算嗎？會(huì)不會(huì)很慢？ 2011-11-12 16:35:10
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我的理解是： 1，在建模的時(shí)候就已經(jīng)帶啦周期性邊界條件，如果想取消，是在BUILD中的MAKE P1 2，優(yōu)化的時(shí)候，讓選擇原始包，是為了更快，如果參雜，就不應(yīng)該轉(zhuǎn)化為原始包 ，就是對(duì)所建立的包優(yōu)化 |
2樓2011-11-10 14:56:22
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