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lbh_xt新蟲 (小有名氣)
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[求助]
邊界條件、溫度、幾何優(yōu)化的問題求助
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求高手幫助: (1)MS建模分子動(dòng)力學(xué)模擬,如果我想模擬的整個(gè)體系的邊界是周期性的(xyz均為周期性的),該怎么設(shè)置呢?我想設(shè)置初始溫度為300K,該怎么設(shè)置呢? 這些設(shè)置是在castep中進(jìn)行設(shè)置?還是在剛開始bulid 體系的時(shí)候就要進(jìn)行設(shè)置呢? (3)如果在加有溫度的情況下,想分時(shí)間分系綜對(duì)系統(tǒng)進(jìn)行模擬以求穩(wěn)態(tài),該怎么辦。 (2)剛開始進(jìn)行幾何優(yōu)化的時(shí)候,我看好多都是build a primitive cell來進(jìn)行優(yōu)化的,可是如果是進(jìn)行體內(nèi)的隨機(jī)摻雜的話,是不是應(yīng)該對(duì)整個(gè)體系進(jìn)行優(yōu)化呢? |

新蟲 (小有名氣)

金蟲 (著名寫手)
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我的理解是: 1,在建模的時(shí)候就已經(jīng)帶啦周期性邊界條件,如果想取消,是在BUILD中的MAKE P1 2,優(yōu)化的時(shí)候,讓選擇原始包,是為了更快,如果參雜,就不應(yīng)該轉(zhuǎn)化為原始包 ,就是對(duì)所建立的包優(yōu)化 |

金蟲 (著名寫手)

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