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mmlzhang

鐵蟲(chóng) (初入文壇)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 2
帖子: 8
在線: 32.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 1386006
注冊(cè): 2011-09-01
性別: GG
專(zhuān)業(yè): 作物分子育種

[求助] 基因的定位與標(biāo)記設(shè)置

大家好
我手里有個(gè)水稻突變體，目前將基因定位到130Kb的物理距離內(nèi)，下載這130Kb的基因序列去NCBI里BLAST設(shè)置30來(lái)對(duì)INDEL等標(biāo)記篩選標(biāo)記時(shí)，親本一能擴(kuò)出來(lái)而且很亮，親本二（突變體）擴(kuò)不出來(lái)或者擴(kuò)出來(lái)很弱的帶，只有少數(shù)幾對(duì)引物兩親本都能擴(kuò)出來(lái)而且沒(méi)多態(tài)，我的是秈梗交的，突變體是T-DNA庫(kù)里獲得的，請(qǐng)問(wèn)為什么多態(tài)這么差，是不是這130Kb范圍內(nèi)序列很亂，含有T-DNA序列，請(qǐng)各位指導(dǎo)指導(dǎo)�。。�！

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心有多寬，路就有多寬

1樓 2011-12-01 11:09:11

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sunwei57

木蟲(chóng) (小有名氣)

應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
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注冊(cè): 2012-03-16
專(zhuān)業(yè): 基因表達(dá)調(diào)控與表觀遺傳學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

130Kb大概就10個(gè)基因左右,你可以根據(jù)表型估計(jì)基因了,再做精細(xì)定位代價(jià)太大,

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回復(fù)此樓

2樓2012-03-16 21:50:17

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