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Illusionist銀蟲 (正式寫手)
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[求助]
如何Scan兩分子距離引起的能量差
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如何Scan兩分子距離引起的能量差 看了半天說明書，只看到二面角，鍵長什么的scan，是否可以scan兩分子的距離。 我要算的是兩平面分子，scan他們面對面的距離。 求租。 |
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2樓2011-12-05 21:15:14
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3樓2011-12-06 08:39:03
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【答案】應(yīng)助回帖
Illusionist(金幣+5): 感激不盡 2011-12-06 10:28:14
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這是苯與氪之間的能量掃描 %chk=benzenen_kr %mem=7500MB %nprocshared=4 #p scan wb97xd/cc-pvdz scf=tight benzenen_kr 0 1 C -1.230622000 0.710500000 0.000000000 C 0.000000000 1.421000000 0.000000000 C 1.230622000 0.710500000 0.000000000 C 1.230622000 -0.710500000 0.000000000 C 0.000000000 -1.421000000 0.000000000 C -1.230622000 -0.710500000 0.000000000 H 0.000000000 2.491000000 0.000000000 H -2.157269000 1.245500000 0.000000000 H -2.157269000 -1.245500000 0.000000000 H 0.000000000 -2.491000000 0.000000000 H 2.157269000 -1.245500000 0.000000000 H 2.157269000 1.245500000 0.000000000 x 0.000000000 0.000000000 0.000000000 Kr 13 R 5 90. 1 90. R 3.4 8 0.05 固定苯不動，X為虛原子，不影響體系能量。 Kr 13 R 5 90. 1 90.這一項(xiàng)描述的是KR與苯環(huán)的位置關(guān)系，與13號原子X的距離R,與5號原子的二面角為90度（一定要寫點(diǎn)），與1號原子的二面角為90.這些嗎，描述能夠保證KR與苯環(huán)是垂直的 R 3.4 8 0.05 表示KR與苯環(huán)的初識距離為3.4，一工掃描8個(gè)點(diǎn)，每個(gè)點(diǎn)走0.05步，即 3.4 3.45 3.5 3.55 。。。每個(gè)點(diǎn)有相應(yīng)的能量 |
4樓2011-12-06 09:55:25
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5樓2011-12-06 11:46:35
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6樓2011-12-06 14:33:53
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