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wntc木蟲 (正式寫手)
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[求助]
這個圖是用哪個軟件做出來的
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謝謝! electrostatic surface potentials mapped onto a surface of total electron density for TET (left) and PFT (right). Regions of higher |
鐵桿木蟲 (著名寫手)

鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
站在計算化學入門的門檻上

版主 (著名寫手)
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Sobereva在以前回答這個問題時說: “你給出的這個圖是用Molekel 4.x版本做的。務必要注意,Molekel自己生成的靜電勢數(shù)據是通過Mulliken原子電荷計算的,這樣的靜電勢在很多情況下哪怕連定性正確都說不上(因此很多用了Molekel做靜電勢圖的文章里的數(shù)據是沒意義的)。關于Molekel做靜電勢圖的問題,稍后我會在我的blog里寫個文章單獨談談。 分子內部區(qū)域靜電勢主要由原子核電荷所主導,是很大的正值,實際上這些區(qū)域的靜電勢沒什么意義。在Multiwfn里,數(shù)值超過最大上限的區(qū)域會顯示為白色。 如果用等值線方式來繪制這張圖,就會看到分子內部區(qū)域的靜電勢會顯示出來。” 同時又說: “Multiwfn里面不支持這種填色等值面圖。gv、chemcraft、vmd等等都可以將一個格點文件(靜電勢數(shù)據)投影到另一個格點文件(電子密度)的等值面上。但是色彩刻度都是連續(xù)的,不支持這種離散的方式。色彩刻度條自行用photoshop貼到圖中合適的位置并標上數(shù)值即可! |
至尊木蟲 (著名寫手)
本人已永久離開小木蟲
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