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wntc木蟲 (正式寫手)
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[求助]
這個(gè)圖是用哪個(gè)軟件做出來的
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謝謝！ electrostatic surface potentials mapped onto a surface of total electron density for TET (left) and PFT (right). Regions of higher |
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zhou2009
版主 (著名寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
wntc(金幣+6): 謝謝！我試試看 2011-12-13 14:11:25
ben_ladeng(金幣+2): 2011-12-14 07:33:57
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
wntc(金幣+6): 謝謝！我試試看 2011-12-13 14:11:25
ben_ladeng(金幣+2): 2011-12-14 07:33:57
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Sobereva在以前回答這個(gè)問題時(shí)說： “你給出的這個(gè)圖是用Molekel 4.x版本做的。務(wù)必要注意，Molekel自己生成的靜電勢(shì)數(shù)據(jù)是通過Mulliken原子電荷計(jì)算的，這樣的靜電勢(shì)在很多情況下哪怕連定性正確都說不上（因此很多用了Molekel做靜電勢(shì)圖的文章里的數(shù)據(jù)是沒意義的）。關(guān)于Molekel做靜電勢(shì)圖的問題，稍后我會(huì)在我的blog里寫個(gè)文章單獨(dú)談?wù)劇?br /> 分子內(nèi)部區(qū)域靜電勢(shì)主要由原子核電荷所主導(dǎo)，是很大的正值，實(shí)際上這些區(qū)域的靜電勢(shì)沒什么意義。在Multiwfn里，數(shù)值超過最大上限的區(qū)域會(huì)顯示為白色。 如果用等值線方式來繪制這張圖，就會(huì)看到分子內(nèi)部區(qū)域的靜電勢(shì)會(huì)顯示出來。” 同時(shí)又說： “Multiwfn里面不支持這種填色等值面圖。gv、chemcraft、vmd等等都可以將一個(gè)格點(diǎn)文件（靜電勢(shì)數(shù)據(jù)）投影到另一個(gè)格點(diǎn)文件（電子密度）的等值面上。但是色彩刻度都是連續(xù)的，不支持這種離散的方式。色彩刻度條自行用photoshop貼到圖中合適的位置并標(biāo)上數(shù)值即可。” |
4樓2011-12-13 08:58:01
lihb734
鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
站在計(jì)算化學(xué)入門的門檻上
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3樓2011-12-13 08:06:28
sobereva
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本人已永久離開小木蟲
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zhou2009(金幣+2): 2011-12-13 17:32:16
zhou2009(金幣+2): 2011-12-13 17:32:16
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作圖方法和相關(guān)討論見此文 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=3451419 |
5樓2011-12-13 13:36:11
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