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zhongyunxia新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
急！能量最小化出問(wèn)題
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各位，我用gromacs做能量最小化，開(kāi)始是用的是steep，dt=0.001 nsteps=10000,結(jié)果說(shuō)收斂機(jī)器精度但是最大力小于設(shè)定的emtol(1000),然后我用cg，結(jié)果報(bào)錯(cuò)：Fatall error:21 of the 14720 bonded interactions could not calculated because some atom involved moved further apart than the multi-body cut-off distance (1.4nm) or the two_body cut-off distance (1.4nm),see option -rdd,for pairs and tabulated bonds also see option -ddcheck 請(qǐng)求給位高手相助，我感激不盡！ |
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2樓2011-12-15 16:02:56
明月照清渠
金蟲(chóng) (小有名氣)
- 應(yīng)助: 10 (幼兒園)
- 金幣: 3550.4
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- 專(zhuān)業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2012-12-07 10:10:34
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