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robertpeter2005木蟲 (正式寫手)
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[求助]
請問大家做徑向分布函數的時候結果有沒有趨近于1��？ 已有2人參與
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請問大家做徑向分布函數的三個結果，一般用哪個啊？論壇里面有人說用那個standard的，但是我發(fā)現用standard做出的圖結果沒有趨近于1啊，是不是不對�。糠炊矣胏arnal.xmgr做出的圖貌似結果最后是趨近于一的，難道是我做錯了？看amber說明和官方郵件里面說 carnal style RDF contains un-normalized data, the other two are normalized RDFs. The standard style RDF presumes a density value of water unless assigned other-wise. The "volume" one is using volume of the box to calculate the density，但是標準的并不歸一��？另外看到一些文獻里面似乎都是用那個standard.xmgr做的圖解釋這個分布函數的，里面的值最后都沒有趨近于1,這樣的解釋對嗎？但是我在陳正隆的2007版分子模擬書里面看到徑向分布函數圖最后應該是趨近于1的啊？書里面應該不會錯的。如果那樣，那amber里面的那個standard又該怎么解釋呢？另外，結果文件里面的那三行究竟是表示什么意思啊？ 各位大俠，有人知道是為什么嗎？還望不吝賜教��！ |
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chaizhm
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【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數 +1
御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-12-21 18:44:43
感謝參與，應助指數 +1
御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-12-21 18:44:43
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基本上都是趨于1的~ As long as the gas is dilute, the correlations in the positions of the atoms that g(r) takes into account are due to the potential ϕ(r) that an atom at P feels owing to the presence of an atom at O. Using the Boltzmann distribution law, If ϕ(r) were zero for all r – i.e., if the atoms did not exert any influence on each other, then g(r) = 1 for all r. |
3樓2011-12-21 08:52:04
robertpeter2005
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