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robertpeter2005木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
請(qǐng)問(wèn)大家做徑向分布函數(shù)的時(shí)候結(jié)果有沒(méi)有趨近于1��？ 已有2人參與
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請(qǐng)問(wèn)大家做徑向分布函數(shù)的三個(gè)結(jié)果，一般用哪個(gè)��？論壇里面有人說(shuō)用那個(gè)standard的，但是我發(fā)現(xiàn)用standard做出的圖結(jié)果沒(méi)有趨近于1啊，是不是不對(duì)��？反而我用carnal.xmgr做出的圖貌似結(jié)果最后是趨近于一的，難道是我做錯(cuò)了？看amber說(shuō)明和官方郵件里面說(shuō) carnal style RDF contains un-normalized data, the other two are normalized RDFs. The standard style RDF presumes a density value of water unless assigned other-wise. The "volume" one is using volume of the box to calculate the density，但是標(biāo)準(zhǔn)的并不歸一��？另外看到一些文獻(xiàn)里面似乎都是用那個(gè)standard.xmgr做的圖解釋這個(gè)分布函數(shù)的，里面的值最后都沒(méi)有趨近于1,這樣的解釋對(duì)嗎？但是我在陳正隆的2007版分子模擬書(shū)里面看到徑向分布函數(shù)圖最后應(yīng)該是趨近于1的�。繒�(shū)里面應(yīng)該不會(huì)錯(cuò)的。如果那樣，那amber里面的那個(gè)standard又該怎么解釋呢？另外，結(jié)果文件里面的那三行究竟是表示什么意思��？ 各位大俠，有人知道是為什么嗎？還望不吝賜教��！ |
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2樓2011-12-20 10:51:17
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-12-21 18:44:43
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
御劍江湖(金幣+4): 謝謝 2011-12-21 18:44:43
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基本上都是趨于1的~ As long as the gas is dilute, the correlations in the positions of the atoms that g(r) takes into account are due to the potential ϕ(r) that an atom at P feels owing to the presence of an atom at O. Using the Boltzmann distribution law, If ϕ(r) were zero for all r – i.e., if the atoms did not exert any influence on each other, then g(r) = 1 for all r. |
3樓2011-12-21 08:52:04
robertpeter2005
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