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[求助]
點(diǎn)突變后蛋白結(jié)構(gòu)變化預(yù)測
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| 現(xiàn)在我做了一個(gè)蛋白的一系列賴氨酸突變體,我想看一下蛋白的結(jié)構(gòu)是否發(fā)生了變化,請問有什么比較簡單的軟件可用?最好是輸入氨基酸序列就可以出結(jié)構(gòu)的,太復(fù)雜的我也不會(huì),如果有人會(huì)的話,幫我弄一下也好,謝謝 |
【分子生物】EPI帖 |
至尊木蟲 (正式寫手)
| swiss-model進(jìn)行模建的話,肯定不會(huì)有大影響,除非你的的氨基酸位點(diǎn)對空間十分重要,就像血紅細(xì)胞的那個(gè)突變一下。但是i可能性不大,如果你想精確分析的話,還是用一些專業(yè)軟件比較好,比如DS里面就有定點(diǎn)突變模塊,還用pp,它是和DS連用的,還用MOE,精度會(huì)差點(diǎn),最好就是模建之后跑個(gè)動(dòng)力學(xué)進(jìn)行一下優(yōu)化,總之如果要求高的話,整個(gè)過程還是很繁瑣的。建議找個(gè)認(rèn)識的生物信息學(xué)的朋友幫幫忙。 |

榮譽(yù)版主 (知名作家)
至尊木蟲 (著名寫手)
至尊木蟲 (著名寫手)
金蟲 (初入文壇)
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http://swissmodel.expasy.org/wor ... _simple1&userid LZ點(diǎn)這個(gè)網(wǎng)頁,提交你的氨基酸序列就可以 |
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