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Flack因子是-0.03,手性群,說(shuō)明什么。。。
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得到一個(gè)單核的晶體,是手性群,F(xiàn)lack參數(shù)低,非手性配體做的,有必要做CD譜嗎,想寫到畢業(yè)論文里,怎么解釋下呢,請(qǐng)各位大俠指點(diǎn)! |
單晶解析 | 專用帖子集 | 晶體實(shí)例 | 單晶資料 |
單晶解析 |

木蟲 (正式寫手)
One for All, All for One
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因?yàn)槭中苑肿颖旧淼闹匾裕瑢?dǎo)致經(jīng)常出現(xiàn)嘗試從手性結(jié)構(gòu)(即具有手性的晶體結(jié)構(gòu))來(lái)判斷分子手性(絕對(duì)構(gòu)型)的問(wèn)題。這是個(gè)很有意思的問(wèn)題。簡(jiǎn)言之,即手性晶體結(jié)構(gòu)和手性分子之間到底是怎樣的關(guān)系。 首先要明確的是手性分子結(jié)構(gòu),手性晶體結(jié)構(gòu)和手性空間群是完全不同的三個(gè)概念。三者談?wù)摰膶?duì)象分別是分子結(jié)構(gòu),(分子)晶體的結(jié)構(gòu)和空間群本身。在230個(gè)空間群中,有11對(duì)(22個(gè))為手性空間群。但是可以與手性晶體結(jié)構(gòu)兼容的空間群有65個(gè)。具有手性的晶體結(jié)構(gòu)一定是非中心對(duì)稱的。 手性晶體結(jié)構(gòu)的絕對(duì)結(jié)構(gòu)是可以通過(guò)Flack參數(shù)判斷的。Flack 參數(shù)定義的物理背景是由兩個(gè)或更多components構(gòu)成的反演孿晶。Flack=0 和1分別對(duì)應(yīng)于呈中心對(duì)稱的兩個(gè)部分。這就意味這Flack參數(shù)適用于所有非中心對(duì)稱的空間群,共有138個(gè)。 只有當(dāng)Flack 參數(shù)本身及其標(biāo)準(zhǔn)差都滿足一定條件的時(shí)候,我們可以認(rèn)為絕對(duì)晶體結(jié)構(gòu)能夠確定下來(lái)。一般來(lái)說(shuō),這樣的條件是:Flack<0.04, sigma(Flack)/Flack<3.0.當(dāng)有其他證據(jù)時(shí),F(xiàn)lack可以放松到0.10.這一條件還式比較嚴(yán)格的,目的是使結(jié)構(gòu)分析的人不要僅僅根據(jù)一個(gè)Flack參數(shù),輕易就給出絕對(duì)結(jié)構(gòu)的信息。 如果結(jié)構(gòu)修正的結(jié)果給出了可靠的Flack參數(shù),只能夠證明絕對(duì)晶體結(jié)構(gòu)是正確的。此時(shí),空間群一定是非中心對(duì)稱的。中心對(duì)稱的結(jié)構(gòu),F(xiàn)lack 參數(shù)沒(méi)有定義,這可以從Flack 參數(shù)的物理背景去理解,因?yàn)橹行膶?duì)稱的結(jié)構(gòu)不可能存在反演孿晶,也就無(wú)所謂Flack參數(shù)。 那么對(duì)于一個(gè)正確的絕對(duì)結(jié)構(gòu),其中的分子手性有是怎樣的呢? 1) 如果空間群中含有旋轉(zhuǎn)反演,旋轉(zhuǎn)反映,或滑移,則分子的絕對(duì)構(gòu)型不能確定。原因如下: 因?yàn)槿羯鲜鰟?dòng)作存在于分子內(nèi),則分子為非手性,若存在于分子間,則對(duì)映體同時(shí)存在與晶體中。 2) 若空間群不含上述對(duì)稱,則有3種情況: A. 晶體有單一手性的分子構(gòu)成,此時(shí)可以確定分子絕對(duì)構(gòu)型; B. 晶體由對(duì)映體分子構(gòu)成,即對(duì)映體同時(shí)存在于晶體中。例如很多結(jié)構(gòu)中不對(duì)稱單元有兩個(gè)分子構(gòu)成,這兩個(gè)分子為對(duì)映體,且通過(guò)非晶體學(xué)對(duì)稱中心聯(lián)系。此時(shí)無(wú)法確定分子絕對(duì)構(gòu)型。 C. 晶體有非手性分子構(gòu)成。沒(méi)有可能也沒(méi)有必要確定分子的絕對(duì)構(gòu)型。 總之,需注意一下幾點(diǎn) 1. Flack 參數(shù)首先要判斷是否有意義。在有意義的時(shí)候,可以確定的是晶體的絕對(duì)結(jié)構(gòu),而不是組成晶體的分子的絕對(duì)構(gòu)型。 2. 晶體的絕對(duì)結(jié)構(gòu)和分子的絕對(duì)構(gòu)型之間的關(guān)系還是比較復(fù)雜,沒(méi)有簡(jiǎn)單的一一對(duì)應(yīng)關(guān)系。 3. 但是有一點(diǎn)是非常明確的:如果晶體僅由一種絕對(duì)構(gòu)型的手性分子組成,則其晶體結(jié)構(gòu)一定是手性的。反之不成立。 1L Flack=-0.03, 如果其標(biāo)準(zhǔn)差也不大的話,可以認(rèn)為晶體的絕對(duì)結(jié)構(gòu)是正確的。其中的分子絕對(duì)構(gòu)型仍然需要具體分析判斷。1L所說(shuō)的手性群,我理解很可能是與手性晶體結(jié)構(gòu)兼容的65種空間群之一,但不一定是那22個(gè)手性群之一。 |

至尊木蟲 (著名寫手)
| Flack因子接近0說(shuō)明是單一手性的晶體/化合物,但只能說(shuō)明你測(cè)試的那顆單晶/化合物是某種手性的,并不代表著你同一溶液中合成出的所有晶體都是這一手性的,只有經(jīng)過(guò)CD譜驗(yàn)證才能說(shuō)明這個(gè)問(wèn)題,因?yàn)橐话阍谌芤褐械玫降亩际峭庀w混合物,它們的晶體很難從外觀區(qū)分,而測(cè)結(jié)構(gòu)只用一顆晶體。 |
木蟲 (小有名氣)
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