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[求助] 大俠們，我有一個(gè)2kb左右的基因，但我想尋找上下游的序列，改咋做呢？

大俠們，我有一個(gè)2kb左右的基因，但我想尋找上下游的序列，該咋做呢？

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1樓 2011-12-26 11:43:36

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gms2010

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樓: Originally posted by panda73 at 2011-12-26 21:07:13:
如果是已測(cè)序的基因組，就很簡(jiǎn)單：直接blast就可以了
如果是未進(jìn)行基因組測(cè)序的物種，那么可以利用基因組DNA按照側(cè)翼序列克隆方案去克隆兩端序列（好像是有成熟的kit提供全套的解決方案，你可以仔細(xì)查一查）

太感謝了！

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6樓2011-12-27 09:36:45

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panda73

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wanhscn(金幣+6): good！歡迎常來(lái)！ 2011-12-27 14:45:17

如果是已測(cè)序的基因組，就很簡(jiǎn)單：直接blast就可以了
如果是未進(jìn)行基因組測(cè)序的物種，那么可以利用基因組DNA按照側(cè)翼序列克隆方案去克隆兩端序列（好像是有成熟的kit提供全套的解決方案，你可以仔細(xì)查一查）

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2樓2011-12-26 21:07:13

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blackrose8089

引用回帖:

2樓: Originally posted by panda73 at 2011-12-26 21:07:13:
如果是已測(cè)序的基因組，就很簡(jiǎn)單：直接blast就可以了
如果是未進(jìn)行基因組測(cè)序的物種，那么可以利用基因組DNA按照側(cè)翼序列克隆方案去克隆兩端序列（好像是有成熟的kit提供全套的解決方案，你可以仔細(xì)查一查）

3樓2011-12-26 21:28:35

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zhangxn2010

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西瓜(金幣+1): 鼓勵(lì)應(yīng)助 2011-12-29 16:26:33

Tail PCR 是對(duì)已知序列插入位點(diǎn)鑒定的有效方法

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一直向前！

4樓2011-12-27 07:59:44

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jting0912

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西瓜(金幣+1): 鼓勵(lì)新蟲 2011-12-29 16:26:50

到NCBI上找你所要的全部序列，發(fā)送到你的文件夾里，使用Vector NTI軟件對(duì)你的目的基因定位，目的基因前后就是你要的上下游序列。

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5樓2011-12-27 09:15:34

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wanggl2004

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wanhscn(金幣+2): 有道理！ 2011-12-29 09:11:20

如果基因組沒有測(cè)序，采用genome walking的方法，有這樣的試劑盒，谷歌一下就能找到！

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思考是行動(dòng)的種子！

7樓2011-12-27 11:13:54

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jxnufangle

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引用回帖:

7樓: Originally posted by wanggl2004 at 2011-12-27 11:13:54:
如果基因組沒有測(cè)序，采用genome walking的方法，有這樣的試劑盒，谷歌一下就能找到！

對(duì)，這樣簡(jiǎn)單有效

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8樓2011-12-28 19:34:39

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wanggl2004

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引用回帖:

8樓: Originally posted by jxnufangle at 2011-12-28 19:34:39:
對(duì)，這樣簡(jiǎn)單有效

恩！

9樓2011-12-28 21:26:10

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