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Ow-H...O的形成判斷問題
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小弟不是很懂晶體,但最近投的一篇文章涉及到一個晶體,回來的審稿意見中提出氫鍵(Ow-H...O)的形成與否應(yīng)該看給體和受體間的距離,而我的晶體數(shù)據(jù)中只標(biāo)注(Ow-H...O)的距離小于范德華半徑。 好像有文章說不能只和范德華半徑相比,那樣不準(zhǔn)確。小弟就不是很清楚怎么來判定H鍵形成了沒?這個應(yīng)該和什么進行比較來最終判定H鍵的形成與否?是需要和數(shù)據(jù)庫的進行?哪個數(shù)據(jù)庫中有? 望請各位高手指點一下小弟迷津,感激不盡。。。。 能提供點實例最好哈。! |
至尊木蟲 (著名寫手)
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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Table 7. Specified hydrogen bonds (with esds except fixed and riding H) for zxq6. D-H H...A D...A <(DHA) 0.82 2.09 2.879(10) 160.4 O6-H6...OW_$1 0.73(10) 2.39(11) 2.996(7) 141(10) OW-H1W...O1_$1 0.73(10) 2.64(10) 3.226(8) 139(10) OW-H1W...O2_$1 0.69(7) 2.29(8) 2.917(8) 152(8) OW-H2W...O4_$1 這是我的晶體數(shù)據(jù)中一個tab命名的word文檔中的數(shù)據(jù),這個表格中列出來的酒可以肯定是晶體中已經(jīng)生成了這些氫鍵了?感謝啊 |
至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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