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xueshuhan木蟲 (正式寫手)
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[求助]
Perl 編程 請(qǐng)大神們幫忙�。�！生物信息的牛人請(qǐng)進(jìn)
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我是學(xué)生物的研究生，我們一個(gè)老師講perl編程，才學(xué)了10個(gè)小時(shí)，本人對(duì)編程一竅不通，希望好心人幫忙解答，謝謝了�。。� 下面是我的編程： Develop a Perl program that receives as argument on the command linethe id of a nucleotide sequence (in the form db:id) and invokes the"sixpack" Web Service from EBI printing its result. |
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zhusheng303
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【1】問(wèn)題一：如何讓第一個(gè)argument需要為變量 Use $ARGV[n] to display argument. Use $#ARGV to get total number of passed argument to a perl script. 例如：./foo.pl one two three $ARGV[0]：one $ARGV[1]: two $ARGV[2]: three 【2】問(wèn)題二：為什么我在命令欄里輸入核苷酸的ID卻提示命令沒有找到 不好意思，這個(gè)我也沒有用過(guò)。這個(gè)網(wǎng)頁(yè)你可以看看http://www.ebi.ac.uk/Tools/webse ... perl/soap/soap-lite，希望對(duì)你有幫助 |
9樓2012-02-01 11:01:49
xueshuhan
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-It checks the number of arguments received on the command line and if the number is not 1 it prints an error message and exits. -It assigns the first argument to one variable. -It checks with a pattern matching that the variable contains the character ":". If not it prints an error message. -It calls the "sixpack" Web Service as in the examples seen in class passing the received variable. -It assigns to a variable the "outfile" returned by the service. -It prints this variable. |
2樓2012-01-30 22:31:01
xueshuhan
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前一半這樣寫是否正確： #!/usr/bin/perl use strict; use warnings; use SOAP::Lite; if ( $#ARGV < 0 ) { print "Usage: please input "; exit; } # Get the first argumentmy if ( $ARGV[0]<>1 ) { print "There is an error there"; exit; } $input=$ARGV[0]; unless ( $ input =~ m/:/ ） { die ( There is an error there.\n ) } |
3樓2012-01-31 02:03:29
zhusheng303
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ben_ladeng(金幣+1): 歡迎常來(lái) 2012-01-31 13:58:28
xueshuhan: 回帖置頂 2012-01-31 16:46:17
ben_ladeng(金幣+1): 歡迎常來(lái) 2012-01-31 13:58:28
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【1】當(dāng)你使用”use strict; use warnings ”, 語(yǔ)句"$input=$ARGV[0];"應(yīng)該寫成“my $input=$ARGV[0]”，“my”定義變量的作用，限定變量的作用域。 【2】“die ( There is an error there.\n )”，最好寫成“die （There is an error there.\n )；”。 【3】“if ( $ARGV[0]<>1 ) ” 這個(gè)語(yǔ)句，我沒有看懂。 |
4樓2012-01-31 10:13:09
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