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astringent銅蟲 (著名寫手)
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[求助]
如何計算resp，esp，chelpg電荷
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最近看文獻(xiàn)的時候，有些用的是resp，有的是esp還有chelpg電荷，請問這幾個電荷有什么區(qū)別，如果我自己用gaussian做這三種電荷，請問表頭如何輸入？還需要其他軟件嗎？ 請大家指點(diǎn) |
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sobereva
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【答案】應(yīng)助回帖
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ESP電荷是一類統(tǒng)稱，包含了RESP、CHELPG等各種擬合靜電勢電荷。 比較經(jīng)典、通用的擬合靜電勢電荷是Merz-kollman(MK)電荷和CHELPG電荷。CHELPG電荷主要優(yōu)點(diǎn)是旋轉(zhuǎn)不變性好，即結(jié)果對于分子朝向敏感性很低。直接用pop=chelpg關(guān)鍵詞即可。 RESP比較適合用于生成分子力場的電荷，是在一般擬合靜電勢過程中加入了限制勢，使內(nèi)部原子電荷的數(shù)值不穩(wěn)定性降低，另外也考慮了解決原子電荷的等價性問題。RESP電荷通常用AmberTools（免費(fèi)）里的Antechamber程序獲得（需要利用Gaussian產(chǎn)生的靜電勢數(shù)據(jù)作為輸入），也可以用R.E.D程序獲得。Gaussian無法直接得到RESP電荷。 |
2樓2012-02-02 06:27:31
fwenling0506
木蟲 (小有名氣)
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3樓2012-05-10 10:53:49
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